Protein–RNA interactions for Protein: O35474

Edil3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edil3O35474 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Edil3O35474 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Edil3O35474 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Edil3O35474 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Edil3O35474 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Edil3O35474 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Edil3O35474 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Edil3O35474 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Edil3O35474 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Edil3O35474 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Edil3O35474 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Edil3O35474 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Edil3O35474 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Edil3O35474 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Edil3O35474 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Edil3O35474 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Edil3O35474 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Edil3O35474 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Edil3O35474 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Edil3O35474 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Edil3O35474 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Edil3O35474 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Edil3O35474 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Edil3O35474 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Edil3O35474 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Edil3O35474 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Edil3O35474 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Edil3O35474 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Edil3O35474 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Edil3O35474 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Edil3O35474 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Edil3O35474 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Edil3O35474 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Edil3O35474 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Edil3O35474 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Edil3O35474 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Edil3O35474 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Edil3O35474 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Edil3O35474 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Edil3O35474 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Edil3O35474 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Edil3O35474 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Edil3O35474 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Edil3O35474 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Edil3O35474 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Edil3O35474 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Edil3O35474 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Edil3O35474 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Edil3O35474 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Edil3O35474 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Edil3O35474 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Edil3O35474 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Edil3O35474 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Edil3O35474 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Edil3O35474 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Edil3O35474 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Edil3O35474 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Edil3O35474 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Edil3O35474 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Edil3O35474 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Edil3O35474 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Edil3O35474 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Edil3O35474 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Edil3O35474 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Edil3O35474 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Edil3O35474 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Edil3O35474 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Edil3O35474 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Edil3O35474 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Edil3O35474 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Edil3O35474 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Edil3O35474 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Edil3O35474 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Edil3O35474 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Edil3O35474 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Edil3O35474 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Edil3O35474 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Edil3O35474 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Edil3O35474 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Edil3O35474 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Edil3O35474 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Edil3O35474 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Edil3O35474 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Edil3O35474 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Edil3O35474 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Edil3O35474 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Edil3O35474 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Edil3O35474 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Edil3O35474 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Edil3O35474 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Edil3O35474 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Edil3O35474 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Edil3O35474 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Edil3O35474 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Edil3O35474 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Edil3O35474 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Edil3O35474 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Edil3O35474 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Edil3O35474 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Edil3O35474 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms