Protein–RNA interactions for Protein: O35392

Foxd2, Forkhead box protein D2, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd2O35392 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Foxd2O35392 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Foxd2O35392 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Foxd2O35392 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Foxd2O35392 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Foxd2O35392 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Foxd2O35392 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Foxd2O35392 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Foxd2O35392 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Foxd2O35392 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Foxd2O35392 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Foxd2O35392 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Foxd2O35392 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Foxd2O35392 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Foxd2O35392 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Foxd2O35392 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Foxd2O35392 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Foxd2O35392 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Foxd2O35392 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Foxd2O35392 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Foxd2O35392 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Foxd2O35392 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Foxd2O35392 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Foxd2O35392 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Foxd2O35392 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Foxd2O35392 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Foxd2O35392 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Foxd2O35392 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Foxd2O35392 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Foxd2O35392 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Foxd2O35392 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Foxd2O35392 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Foxd2O35392 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Foxd2O35392 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Foxd2O35392 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Foxd2O35392 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Foxd2O35392 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Foxd2O35392 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Foxd2O35392 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Foxd2O35392 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Foxd2O35392 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Foxd2O35392 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Foxd2O35392 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Foxd2O35392 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Foxd2O35392 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Foxd2O35392 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Foxd2O35392 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Foxd2O35392 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Foxd2O35392 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Foxd2O35392 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Foxd2O35392 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Foxd2O35392 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Foxd2O35392 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Foxd2O35392 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Foxd2O35392 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Foxd2O35392 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Foxd2O35392 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Foxd2O35392 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Foxd2O35392 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Foxd2O35392 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Foxd2O35392 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Foxd2O35392 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Foxd2O35392 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Foxd2O35392 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Foxd2O35392 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Foxd2O35392 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Foxd2O35392 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Foxd2O35392 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Foxd2O35392 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
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Foxd2O35392 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Foxd2O35392 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Foxd2O35392 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Foxd2O35392 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Foxd2O35392 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Foxd2O35392 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Foxd2O35392 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Foxd2O35392 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Foxd2O35392 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Foxd2O35392 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Foxd2O35392 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Foxd2O35392 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Foxd2O35392 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Foxd2O35392 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Foxd2O35392 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Foxd2O35392 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Foxd2O35392 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Foxd2O35392 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Foxd2O35392 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Foxd2O35392 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Foxd2O35392 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Foxd2O35392 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Foxd2O35392 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Foxd2O35392 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Foxd2O35392 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Foxd2O35392 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Foxd2O35392 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
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Foxd2O35392 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms