Protein–RNA interactions for Protein: O35379

Abcc1, Multidrug resistance-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc1O35379 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Abcc1O35379 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Abcc1O35379 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Abcc1O35379 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Abcc1O35379 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Abcc1O35379 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Abcc1O35379 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Abcc1O35379 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Abcc1O35379 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Abcc1O35379 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Abcc1O35379 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Abcc1O35379 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Abcc1O35379 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Abcc1O35379 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Abcc1O35379 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Abcc1O35379 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Abcc1O35379 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Abcc1O35379 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Abcc1O35379 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Abcc1O35379 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Abcc1O35379 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Abcc1O35379 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Abcc1O35379 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Abcc1O35379 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Abcc1O35379 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Abcc1O35379 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Abcc1O35379 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Abcc1O35379 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Abcc1O35379 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Abcc1O35379 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Abcc1O35379 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Abcc1O35379 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Abcc1O35379 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Abcc1O35379 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Abcc1O35379 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Abcc1O35379 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Abcc1O35379 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Abcc1O35379 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Abcc1O35379 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Abcc1O35379 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Abcc1O35379 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Abcc1O35379 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Abcc1O35379 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Abcc1O35379 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Abcc1O35379 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Abcc1O35379 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Abcc1O35379 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Abcc1O35379 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Abcc1O35379 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Abcc1O35379 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Abcc1O35379 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Abcc1O35379 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Abcc1O35379 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Abcc1O35379 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Abcc1O35379 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Abcc1O35379 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Abcc1O35379 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Abcc1O35379 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Abcc1O35379 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Abcc1O35379 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Abcc1O35379 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Abcc1O35379 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Abcc1O35379 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Abcc1O35379 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Abcc1O35379 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Abcc1O35379 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Abcc1O35379 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Abcc1O35379 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Abcc1O35379 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Abcc1O35379 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Abcc1O35379 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Abcc1O35379 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Abcc1O35379 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Abcc1O35379 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Abcc1O35379 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Abcc1O35379 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Abcc1O35379 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Abcc1O35379 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Abcc1O35379 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Abcc1O35379 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Abcc1O35379 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Abcc1O35379 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Abcc1O35379 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Abcc1O35379 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Abcc1O35379 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Abcc1O35379 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Abcc1O35379 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Abcc1O35379 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Abcc1O35379 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Abcc1O35379 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Abcc1O35379 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Abcc1O35379 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Abcc1O35379 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Abcc1O35379 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Abcc1O35379 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Abcc1O35379 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Abcc1O35379 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Abcc1O35379 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Abcc1O35379 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Abcc1O35379 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms