Protein–RNA interactions for Protein: O35324

Sh2d1b, SH2 domain-containing protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d1bO35324 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sh2d1bO35324 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sh2d1bO35324 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Sh2d1bO35324 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Sh2d1bO35324 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sh2d1bO35324 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sh2d1bO35324 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sh2d1bO35324 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sh2d1bO35324 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sh2d1bO35324 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sh2d1bO35324 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sh2d1bO35324 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sh2d1bO35324 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sh2d1bO35324 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sh2d1bO35324 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sh2d1bO35324 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sh2d1bO35324 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sh2d1bO35324 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sh2d1bO35324 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sh2d1bO35324 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sh2d1bO35324 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sh2d1bO35324 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sh2d1bO35324 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sh2d1bO35324 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Sh2d1bO35324 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sh2d1bO35324 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sh2d1bO35324 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sh2d1bO35324 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sh2d1bO35324 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sh2d1bO35324 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sh2d1bO35324 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sh2d1bO35324 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sh2d1bO35324 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sh2d1bO35324 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sh2d1bO35324 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sh2d1bO35324 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Sh2d1bO35324 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sh2d1bO35324 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sh2d1bO35324 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sh2d1bO35324 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sh2d1bO35324 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sh2d1bO35324 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sh2d1bO35324 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sh2d1bO35324 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sh2d1bO35324 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sh2d1bO35324 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sh2d1bO35324 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sh2d1bO35324 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sh2d1bO35324 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sh2d1bO35324 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sh2d1bO35324 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sh2d1bO35324 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sh2d1bO35324 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sh2d1bO35324 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sh2d1bO35324 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sh2d1bO35324 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sh2d1bO35324 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sh2d1bO35324 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sh2d1bO35324 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sh2d1bO35324 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sh2d1bO35324 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sh2d1bO35324 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sh2d1bO35324 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sh2d1bO35324 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sh2d1bO35324 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sh2d1bO35324 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sh2d1bO35324 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sh2d1bO35324 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sh2d1bO35324 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sh2d1bO35324 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sh2d1bO35324 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sh2d1bO35324 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sh2d1bO35324 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sh2d1bO35324 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sh2d1bO35324 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sh2d1bO35324 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sh2d1bO35324 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sh2d1bO35324 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sh2d1bO35324 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sh2d1bO35324 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sh2d1bO35324 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sh2d1bO35324 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sh2d1bO35324 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sh2d1bO35324 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Sh2d1bO35324 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sh2d1bO35324 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sh2d1bO35324 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sh2d1bO35324 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sh2d1bO35324 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sh2d1bO35324 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sh2d1bO35324 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh2d1bO35324 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh2d1bO35324 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh2d1bO35324 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh2d1bO35324 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh2d1bO35324 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh2d1bO35324 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh2d1bO35324 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh2d1bO35324 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh2d1bO35324 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms