Protein–RNA interactions for Protein: O35245

Pkd2, Polycystin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2O35245 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pkd2O35245 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Pkd2O35245 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pkd2O35245 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pkd2O35245 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Pkd2O35245 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pkd2O35245 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pkd2O35245 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pkd2O35245 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pkd2O35245 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pkd2O35245 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pkd2O35245 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pkd2O35245 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pkd2O35245 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pkd2O35245 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Pkd2O35245 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pkd2O35245 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Pkd2O35245 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pkd2O35245 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pkd2O35245 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pkd2O35245 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pkd2O35245 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pkd2O35245 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pkd2O35245 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pkd2O35245 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pkd2O35245 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pkd2O35245 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pkd2O35245 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pkd2O35245 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pkd2O35245 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pkd2O35245 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pkd2O35245 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pkd2O35245 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pkd2O35245 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pkd2O35245 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pkd2O35245 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pkd2O35245 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pkd2O35245 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pkd2O35245 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pkd2O35245 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pkd2O35245 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pkd2O35245 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pkd2O35245 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pkd2O35245 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pkd2O35245 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pkd2O35245 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pkd2O35245 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pkd2O35245 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pkd2O35245 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pkd2O35245 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pkd2O35245 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Pkd2O35245 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pkd2O35245 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pkd2O35245 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pkd2O35245 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pkd2O35245 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pkd2O35245 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pkd2O35245 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pkd2O35245 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pkd2O35245 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pkd2O35245 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pkd2O35245 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pkd2O35245 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pkd2O35245 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pkd2O35245 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pkd2O35245 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pkd2O35245 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pkd2O35245 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pkd2O35245 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pkd2O35245 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pkd2O35245 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pkd2O35245 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pkd2O35245 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pkd2O35245 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pkd2O35245 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pkd2O35245 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pkd2O35245 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pkd2O35245 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pkd2O35245 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pkd2O35245 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pkd2O35245 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pkd2O35245 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pkd2O35245 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pkd2O35245 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pkd2O35245 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Pkd2O35245 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pkd2O35245 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pkd2O35245 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pkd2O35245 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Pkd2O35245 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pkd2O35245 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pkd2O35245 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pkd2O35245 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pkd2O35245 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pkd2O35245 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pkd2O35245 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pkd2O35245 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pkd2O35245 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pkd2O35245 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pkd2O35245 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms