Protein–RNA interactions for Protein: O35185

Bhlhe40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe40O35185 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Bhlhe40O35185 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Bhlhe40O35185 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Bhlhe40O35185 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Bhlhe40O35185 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Bhlhe40O35185 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Bhlhe40O35185 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Bhlhe40O35185 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Bhlhe40O35185 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Bhlhe40O35185 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Bhlhe40O35185 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Bhlhe40O35185 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Bhlhe40O35185 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Bhlhe40O35185 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Bhlhe40O35185 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Bhlhe40O35185 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Bhlhe40O35185 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Bhlhe40O35185 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Bhlhe40O35185 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Bhlhe40O35185 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Bhlhe40O35185 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Bhlhe40O35185 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Bhlhe40O35185 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Bhlhe40O35185 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Bhlhe40O35185 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Bhlhe40O35185 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Bhlhe40O35185 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Bhlhe40O35185 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Bhlhe40O35185 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Bhlhe40O35185 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Bhlhe40O35185 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Bhlhe40O35185 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Bhlhe40O35185 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Bhlhe40O35185 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bhlhe40O35185 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bhlhe40O35185 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bhlhe40O35185 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bhlhe40O35185 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bhlhe40O35185 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bhlhe40O35185 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bhlhe40O35185 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bhlhe40O35185 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Bhlhe40O35185 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bhlhe40O35185 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bhlhe40O35185 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bhlhe40O35185 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bhlhe40O35185 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bhlhe40O35185 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bhlhe40O35185 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bhlhe40O35185 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bhlhe40O35185 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bhlhe40O35185 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bhlhe40O35185 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Bhlhe40O35185 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bhlhe40O35185 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bhlhe40O35185 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bhlhe40O35185 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bhlhe40O35185 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bhlhe40O35185 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bhlhe40O35185 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bhlhe40O35185 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bhlhe40O35185 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bhlhe40O35185 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bhlhe40O35185 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bhlhe40O35185 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bhlhe40O35185 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bhlhe40O35185 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bhlhe40O35185 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bhlhe40O35185 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bhlhe40O35185 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bhlhe40O35185 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bhlhe40O35185 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bhlhe40O35185 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bhlhe40O35185 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bhlhe40O35185 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bhlhe40O35185 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bhlhe40O35185 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bhlhe40O35185 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bhlhe40O35185 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bhlhe40O35185 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bhlhe40O35185 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bhlhe40O35185 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bhlhe40O35185 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bhlhe40O35185 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bhlhe40O35185 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bhlhe40O35185 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Bhlhe40O35185 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Bhlhe40O35185 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Bhlhe40O35185 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bhlhe40O35185 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bhlhe40O35185 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bhlhe40O35185 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bhlhe40O35185 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bhlhe40O35185 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bhlhe40O35185 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bhlhe40O35185 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bhlhe40O35185 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bhlhe40O35185 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bhlhe40O35185 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bhlhe40O35185 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms