Protein–RNA interactions for Protein: O35177

Nedd9, Enhancer of filamentation 1, mousemouse

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd9O35177 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
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Nedd9O35177 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nedd9O35177 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nedd9O35177 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nedd9O35177 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nedd9O35177 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nedd9O35177 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Nedd9O35177 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nedd9O35177 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nedd9O35177 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Nedd9O35177 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nedd9O35177 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nedd9O35177 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nedd9O35177 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nedd9O35177 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nedd9O35177 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nedd9O35177 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Nedd9O35177 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nedd9O35177 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nedd9O35177 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nedd9O35177 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nedd9O35177 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nedd9O35177 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
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Nedd9O35177 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nedd9O35177 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
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Nedd9O35177 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nedd9O35177 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nedd9O35177 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nedd9O35177 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nedd9O35177 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nedd9O35177 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nedd9O35177 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
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Nedd9O35177 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
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Nedd9O35177 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nedd9O35177 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nedd9O35177 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nedd9O35177 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nedd9O35177 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
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Nedd9O35177 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
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Nedd9O35177 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nedd9O35177 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
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Nedd9O35177 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
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Nedd9O35177 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nedd9O35177 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nedd9O35177 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
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Nedd9O35177 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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Nedd9O35177 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nedd9O35177 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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Nedd9O35177 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nedd9O35177 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nedd9O35177 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nedd9O35177 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nedd9O35177 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nedd9O35177 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nedd9O35177 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nedd9O35177 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nedd9O35177 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nedd9O35177 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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