Protein–RNA interactions for Protein: O35114

Scarb2, Lysosome membrane protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarb2O35114 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scarb2O35114 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scarb2O35114 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scarb2O35114 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scarb2O35114 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scarb2O35114 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scarb2O35114 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scarb2O35114 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scarb2O35114 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Scarb2O35114 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scarb2O35114 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scarb2O35114 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scarb2O35114 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scarb2O35114 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scarb2O35114 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scarb2O35114 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scarb2O35114 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scarb2O35114 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scarb2O35114 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Scarb2O35114 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scarb2O35114 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scarb2O35114 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scarb2O35114 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scarb2O35114 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scarb2O35114 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scarb2O35114 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scarb2O35114 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scarb2O35114 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scarb2O35114 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scarb2O35114 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scarb2O35114 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scarb2O35114 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scarb2O35114 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scarb2O35114 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scarb2O35114 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scarb2O35114 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scarb2O35114 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scarb2O35114 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scarb2O35114 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scarb2O35114 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scarb2O35114 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scarb2O35114 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scarb2O35114 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scarb2O35114 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scarb2O35114 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scarb2O35114 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scarb2O35114 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scarb2O35114 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scarb2O35114 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scarb2O35114 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scarb2O35114 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scarb2O35114 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scarb2O35114 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scarb2O35114 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scarb2O35114 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scarb2O35114 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scarb2O35114 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scarb2O35114 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scarb2O35114 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scarb2O35114 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scarb2O35114 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scarb2O35114 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scarb2O35114 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scarb2O35114 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scarb2O35114 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scarb2O35114 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scarb2O35114 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scarb2O35114 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scarb2O35114 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scarb2O35114 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scarb2O35114 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scarb2O35114 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scarb2O35114 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Scarb2O35114 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scarb2O35114 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scarb2O35114 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scarb2O35114 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scarb2O35114 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scarb2O35114 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scarb2O35114 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Scarb2O35114 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Scarb2O35114 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Scarb2O35114 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scarb2O35114 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scarb2O35114 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scarb2O35114 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scarb2O35114 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scarb2O35114 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Scarb2O35114 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scarb2O35114 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scarb2O35114 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scarb2O35114 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scarb2O35114 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scarb2O35114 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scarb2O35114 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scarb2O35114 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scarb2O35114 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scarb2O35114 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scarb2O35114 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scarb2O35114 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms