Protein–RNA interactions for Protein: O08919

Numbl, Numb-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NumblO08919 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NumblO08919 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NumblO08919 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NumblO08919 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NumblO08919 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NumblO08919 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NumblO08919 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NumblO08919 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NumblO08919 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NumblO08919 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NumblO08919 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NumblO08919 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NumblO08919 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NumblO08919 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NumblO08919 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NumblO08919 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NumblO08919 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NumblO08919 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NumblO08919 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NumblO08919 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NumblO08919 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NumblO08919 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NumblO08919 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NumblO08919 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NumblO08919 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NumblO08919 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NumblO08919 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NumblO08919 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NumblO08919 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NumblO08919 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NumblO08919 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NumblO08919 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NumblO08919 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NumblO08919 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NumblO08919 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NumblO08919 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NumblO08919 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
NumblO08919 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
NumblO08919 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NumblO08919 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
NumblO08919 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NumblO08919 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NumblO08919 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NumblO08919 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NumblO08919 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
NumblO08919 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NumblO08919 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NumblO08919 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NumblO08919 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NumblO08919 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NumblO08919 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NumblO08919 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NumblO08919 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NumblO08919 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NumblO08919 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NumblO08919 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NumblO08919 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NumblO08919 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NumblO08919 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NumblO08919 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NumblO08919 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NumblO08919 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
NumblO08919 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NumblO08919 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NumblO08919 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NumblO08919 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
NumblO08919 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NumblO08919 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NumblO08919 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NumblO08919 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NumblO08919 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NumblO08919 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NumblO08919 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NumblO08919 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NumblO08919 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NumblO08919 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NumblO08919 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NumblO08919 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NumblO08919 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NumblO08919 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NumblO08919 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NumblO08919 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NumblO08919 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NumblO08919 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
NumblO08919 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NumblO08919 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NumblO08919 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NumblO08919 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NumblO08919 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NumblO08919 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NumblO08919 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NumblO08919 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NumblO08919 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NumblO08919 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NumblO08919 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NumblO08919 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NumblO08919 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NumblO08919 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NumblO08919 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NumblO08919 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms