Protein–RNA interactions for Protein: O08542

Efna4, Ephrin-A4, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna4O08542 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Efna4O08542 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Efna4O08542 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Efna4O08542 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Efna4O08542 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Efna4O08542 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Efna4O08542 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Efna4O08542 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Efna4O08542 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Efna4O08542 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Efna4O08542 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Efna4O08542 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Efna4O08542 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Efna4O08542 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Efna4O08542 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Efna4O08542 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Efna4O08542 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Efna4O08542 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Efna4O08542 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Efna4O08542 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Efna4O08542 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Efna4O08542 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Efna4O08542 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Efna4O08542 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Efna4O08542 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Efna4O08542 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Efna4O08542 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Efna4O08542 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Efna4O08542 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Efna4O08542 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Efna4O08542 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Efna4O08542 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Efna4O08542 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Efna4O08542 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Efna4O08542 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Efna4O08542 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Efna4O08542 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Efna4O08542 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Efna4O08542 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Efna4O08542 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Efna4O08542 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Efna4O08542 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Efna4O08542 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Efna4O08542 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Efna4O08542 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Efna4O08542 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Efna4O08542 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Efna4O08542 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Efna4O08542 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Efna4O08542 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Efna4O08542 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Efna4O08542 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Efna4O08542 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Efna4O08542 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Efna4O08542 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Efna4O08542 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Efna4O08542 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Efna4O08542 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Efna4O08542 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Efna4O08542 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Efna4O08542 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Efna4O08542 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Efna4O08542 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Efna4O08542 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Efna4O08542 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Efna4O08542 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Efna4O08542 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Efna4O08542 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Efna4O08542 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Efna4O08542 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Efna4O08542 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Efna4O08542 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Efna4O08542 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Efna4O08542 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Efna4O08542 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Efna4O08542 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Efna4O08542 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Efna4O08542 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Efna4O08542 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Efna4O08542 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Efna4O08542 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Efna4O08542 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Efna4O08542 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Efna4O08542 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Efna4O08542 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Efna4O08542 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Efna4O08542 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Efna4O08542 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Efna4O08542 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Efna4O08542 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Efna4O08542 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Efna4O08542 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Efna4O08542 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Efna4O08542 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Efna4O08542 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Efna4O08542 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Efna4O08542 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Efna4O08542 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Efna4O08542 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Efna4O08542 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms