Protein–RNA interactions for Protein: L7N244

Gm20878, Predicted gene, 20878, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20878L7N244 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm20878L7N244 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm20878L7N244 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm20878L7N244 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm20878L7N244 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm20878L7N244 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm20878L7N244 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm20878L7N244 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm20878L7N244 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm20878L7N244 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm20878L7N244 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm20878L7N244 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm20878L7N244 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm20878L7N244 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm20878L7N244 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm20878L7N244 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm20878L7N244 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm20878L7N244 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm20878L7N244 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm20878L7N244 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm20878L7N244 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm20878L7N244 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm20878L7N244 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm20878L7N244 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm20878L7N244 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm20878L7N244 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm20878L7N244 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm20878L7N244 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm20878L7N244 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm20878L7N244 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm20878L7N244 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm20878L7N244 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm20878L7N244 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm20878L7N244 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm20878L7N244 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm20878L7N244 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm20878L7N244 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm20878L7N244 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm20878L7N244 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm20878L7N244 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm20878L7N244 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm20878L7N244 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm20878L7N244 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm20878L7N244 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm20878L7N244 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm20878L7N244 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm20878L7N244 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm20878L7N244 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm20878L7N244 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm20878L7N244 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm20878L7N244 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm20878L7N244 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm20878L7N244 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm20878L7N244 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm20878L7N244 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm20878L7N244 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm20878L7N244 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm20878L7N244 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm20878L7N244 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm20878L7N244 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm20878L7N244 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm20878L7N244 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm20878L7N244 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm20878L7N244 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm20878L7N244 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm20878L7N244 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm20878L7N244 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm20878L7N244 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm20878L7N244 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm20878L7N244 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm20878L7N244 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm20878L7N244 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm20878L7N244 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm20878L7N244 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm20878L7N244 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm20878L7N244 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm20878L7N244 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm20878L7N244 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm20878L7N244 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm20878L7N244 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm20878L7N244 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm20878L7N244 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm20878L7N244 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm20878L7N244 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm20878L7N244 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm20878L7N244 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm20878L7N244 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm20878L7N244 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm20878L7N244 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm20878L7N244 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm20878L7N244 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm20878L7N244 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm20878L7N244 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm20878L7N244 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm20878L7N244 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm20878L7N244 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm20878L7N244 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm20878L7N244 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm20878L7N244 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm20878L7N244 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms