Protein–RNA interactions for Protein: J3QPL3

Gm5225, Predicted gene 5225, mousemouse

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Length 108 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5225J3QPL3 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm5225J3QPL3 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm5225J3QPL3 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm5225J3QPL3 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm5225J3QPL3 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm5225J3QPL3 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm5225J3QPL3 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm5225J3QPL3 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm5225J3QPL3 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm5225J3QPL3 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm5225J3QPL3 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm5225J3QPL3 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm5225J3QPL3 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm5225J3QPL3 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm5225J3QPL3 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm5225J3QPL3 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm5225J3QPL3 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm5225J3QPL3 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm5225J3QPL3 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm5225J3QPL3 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm5225J3QPL3 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm5225J3QPL3 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm5225J3QPL3 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm5225J3QPL3 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm5225J3QPL3 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm5225J3QPL3 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Gm5225J3QPL3 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm5225J3QPL3 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm5225J3QPL3 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm5225J3QPL3 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm5225J3QPL3 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm5225J3QPL3 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm5225J3QPL3 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Gm5225J3QPL3 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Gm5225J3QPL3 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm5225J3QPL3 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm5225J3QPL3 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm5225J3QPL3 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Gm5225J3QPL3 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm5225J3QPL3 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm5225J3QPL3 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm5225J3QPL3 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm5225J3QPL3 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm5225J3QPL3 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm5225J3QPL3 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm5225J3QPL3 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm5225J3QPL3 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm5225J3QPL3 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Gm5225J3QPL3 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm5225J3QPL3 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm5225J3QPL3 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm5225J3QPL3 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm5225J3QPL3 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm5225J3QPL3 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Gm5225J3QPL3 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Gm5225J3QPL3 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5225J3QPL3 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5225J3QPL3 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5225J3QPL3 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5225J3QPL3 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5225J3QPL3 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5225J3QPL3 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5225J3QPL3 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5225J3QPL3 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5225J3QPL3 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5225J3QPL3 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5225J3QPL3 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5225J3QPL3 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5225J3QPL3 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5225J3QPL3 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5225J3QPL3 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5225J3QPL3 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5225J3QPL3 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5225J3QPL3 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5225J3QPL3 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5225J3QPL3 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5225J3QPL3 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5225J3QPL3 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5225J3QPL3 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5225J3QPL3 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5225J3QPL3 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5225J3QPL3 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5225J3QPL3 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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