Protein–RNA interactions for Protein: J3QNW5

Gm21797, Predicted gene, 21797, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21797J3QNW5 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm21797J3QNW5 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm21797J3QNW5 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm21797J3QNW5 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm21797J3QNW5 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm21797J3QNW5 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm21797J3QNW5 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm21797J3QNW5 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm21797J3QNW5 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm21797J3QNW5 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm21797J3QNW5 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm21797J3QNW5 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm21797J3QNW5 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm21797J3QNW5 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm21797J3QNW5 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm21797J3QNW5 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm21797J3QNW5 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm21797J3QNW5 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm21797J3QNW5 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm21797J3QNW5 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm21797J3QNW5 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm21797J3QNW5 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm21797J3QNW5 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm21797J3QNW5 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm21797J3QNW5 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm21797J3QNW5 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm21797J3QNW5 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm21797J3QNW5 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm21797J3QNW5 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm21797J3QNW5 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm21797J3QNW5 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm21797J3QNW5 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm21797J3QNW5 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm21797J3QNW5 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm21797J3QNW5 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm21797J3QNW5 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm21797J3QNW5 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm21797J3QNW5 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm21797J3QNW5 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm21797J3QNW5 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm21797J3QNW5 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm21797J3QNW5 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm21797J3QNW5 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm21797J3QNW5 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm21797J3QNW5 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm21797J3QNW5 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm21797J3QNW5 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm21797J3QNW5 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm21797J3QNW5 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm21797J3QNW5 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm21797J3QNW5 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm21797J3QNW5 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm21797J3QNW5 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm21797J3QNW5 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm21797J3QNW5 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm21797J3QNW5 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm21797J3QNW5 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm21797J3QNW5 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm21797J3QNW5 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm21797J3QNW5 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm21797J3QNW5 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm21797J3QNW5 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm21797J3QNW5 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm21797J3QNW5 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm21797J3QNW5 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm21797J3QNW5 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm21797J3QNW5 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm21797J3QNW5 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm21797J3QNW5 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm21797J3QNW5 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm21797J3QNW5 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm21797J3QNW5 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm21797J3QNW5 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm21797J3QNW5 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm21797J3QNW5 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm21797J3QNW5 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm21797J3QNW5 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm21797J3QNW5 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm21797J3QNW5 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm21797J3QNW5 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm21797J3QNW5 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm21797J3QNW5 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm21797J3QNW5 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm21797J3QNW5 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm21797J3QNW5 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm21797J3QNW5 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm21797J3QNW5 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm21797J3QNW5 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm21797J3QNW5 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm21797J3QNW5 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm21797J3QNW5 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm21797J3QNW5 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm21797J3QNW5 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm21797J3QNW5 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm21797J3QNW5 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm21797J3QNW5 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm21797J3QNW5 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm21797J3QNW5 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm21797J3QNW5 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm21797J3QNW5 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms