Protein–RNA interactions for Protein: G5E8X0

Cldn20, Claudin, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn20G5E8X0 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn20G5E8X0 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn20G5E8X0 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn20G5E8X0 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn20G5E8X0 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn20G5E8X0 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn20G5E8X0 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn20G5E8X0 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn20G5E8X0 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn20G5E8X0 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn20G5E8X0 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn20G5E8X0 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn20G5E8X0 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn20G5E8X0 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn20G5E8X0 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn20G5E8X0 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn20G5E8X0 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn20G5E8X0 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn20G5E8X0 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn20G5E8X0 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn20G5E8X0 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn20G5E8X0 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn20G5E8X0 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn20G5E8X0 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn20G5E8X0 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn20G5E8X0 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn20G5E8X0 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn20G5E8X0 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn20G5E8X0 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn20G5E8X0 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn20G5E8X0 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn20G5E8X0 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn20G5E8X0 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn20G5E8X0 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn20G5E8X0 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn20G5E8X0 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn20G5E8X0 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn20G5E8X0 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn20G5E8X0 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn20G5E8X0 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn20G5E8X0 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn20G5E8X0 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn20G5E8X0 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn20G5E8X0 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn20G5E8X0 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn20G5E8X0 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn20G5E8X0 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn20G5E8X0 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn20G5E8X0 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn20G5E8X0 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn20G5E8X0 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn20G5E8X0 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn20G5E8X0 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn20G5E8X0 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn20G5E8X0 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn20G5E8X0 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn20G5E8X0 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn20G5E8X0 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn20G5E8X0 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn20G5E8X0 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn20G5E8X0 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn20G5E8X0 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn20G5E8X0 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn20G5E8X0 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn20G5E8X0 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn20G5E8X0 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn20G5E8X0 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn20G5E8X0 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn20G5E8X0 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn20G5E8X0 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn20G5E8X0 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn20G5E8X0 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn20G5E8X0 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn20G5E8X0 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn20G5E8X0 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn20G5E8X0 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn20G5E8X0 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn20G5E8X0 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn20G5E8X0 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn20G5E8X0 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn20G5E8X0 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn20G5E8X0 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn20G5E8X0 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn20G5E8X0 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn20G5E8X0 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn20G5E8X0 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn20G5E8X0 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn20G5E8X0 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn20G5E8X0 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn20G5E8X0 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn20G5E8X0 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn20G5E8X0 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn20G5E8X0 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn20G5E8X0 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn20G5E8X0 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn20G5E8X0 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn20G5E8X0 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn20G5E8X0 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn20G5E8X0 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn20G5E8X0 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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