Protein–RNA interactions for Protein: G3X9Z4

Pcf11, Cleavage and polyadenylation factor subunit homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Predictions only

Length 1,553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcf11G3X9Z4 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Pcf11G3X9Z4 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Pcf11G3X9Z4 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Pcf11G3X9Z4 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Pcf11G3X9Z4 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Pcf11G3X9Z4 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Pcf11G3X9Z4 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Pcf11G3X9Z4 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Pcf11G3X9Z4 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Pcf11G3X9Z4 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Pcf11G3X9Z4 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Pcf11G3X9Z4 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Pcf11G3X9Z4 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Pcf11G3X9Z4 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Pcf11G3X9Z4 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Pcf11G3X9Z4 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Pcf11G3X9Z4 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Pcf11G3X9Z4 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Pcf11G3X9Z4 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Pcf11G3X9Z4 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Pcf11G3X9Z4 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Pcf11G3X9Z4 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Pcf11G3X9Z4 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Pcf11G3X9Z4 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Pcf11G3X9Z4 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Pcf11G3X9Z4 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Pcf11G3X9Z4 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Pcf11G3X9Z4 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Pcf11G3X9Z4 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Pcf11G3X9Z4 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pcf11G3X9Z4 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pcf11G3X9Z4 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pcf11G3X9Z4 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pcf11G3X9Z4 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Pcf11G3X9Z4 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pcf11G3X9Z4 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pcf11G3X9Z4 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pcf11G3X9Z4 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pcf11G3X9Z4 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pcf11G3X9Z4 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pcf11G3X9Z4 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pcf11G3X9Z4 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pcf11G3X9Z4 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Pcf11G3X9Z4 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Pcf11G3X9Z4 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Pcf11G3X9Z4 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Pcf11G3X9Z4 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Pcf11G3X9Z4 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Pcf11G3X9Z4 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Pcf11G3X9Z4 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Pcf11G3X9Z4 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Pcf11G3X9Z4 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Pcf11G3X9Z4 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Pcf11G3X9Z4 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Pcf11G3X9Z4 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Pcf11G3X9Z4 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Pcf11G3X9Z4 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Pcf11G3X9Z4 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Pcf11G3X9Z4 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Pcf11G3X9Z4 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Pcf11G3X9Z4 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Pcf11G3X9Z4 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Pcf11G3X9Z4 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Pcf11G3X9Z4 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Pcf11G3X9Z4 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Pcf11G3X9Z4 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Pcf11G3X9Z4 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Pcf11G3X9Z4 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Pcf11G3X9Z4 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Pcf11G3X9Z4 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Pcf11G3X9Z4 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Pcf11G3X9Z4 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Pcf11G3X9Z4 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Pcf11G3X9Z4 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Pcf11G3X9Z4 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Pcf11G3X9Z4 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Pcf11G3X9Z4 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pcf11G3X9Z4 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pcf11G3X9Z4 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pcf11G3X9Z4 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Pcf11G3X9Z4 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pcf11G3X9Z4 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pcf11G3X9Z4 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pcf11G3X9Z4 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pcf11G3X9Z4 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pcf11G3X9Z4 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Pcf11G3X9Z4 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pcf11G3X9Z4 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pcf11G3X9Z4 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Pcf11G3X9Z4 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
Pcf11G3X9Z4 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
Pcf11G3X9Z4 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Pcf11G3X9Z4 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Pcf11G3X9Z4 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Pcf11G3X9Z4 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Pcf11G3X9Z4 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Pcf11G3X9Z4 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Pcf11G3X9Z4 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Pcf11G3X9Z4 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Pcf11G3X9Z4 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 138.3 ms