Protein–RNA interactions for Protein: G3UW60

Susd5, MCG14773, mousemouse

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd5G3UW60 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Susd5G3UW60 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Susd5G3UW60 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Susd5G3UW60 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Susd5G3UW60 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Susd5G3UW60 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Susd5G3UW60 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Susd5G3UW60 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Susd5G3UW60 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Susd5G3UW60 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Susd5G3UW60 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Susd5G3UW60 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Susd5G3UW60 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Susd5G3UW60 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Susd5G3UW60 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Susd5G3UW60 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Susd5G3UW60 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Susd5G3UW60 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Susd5G3UW60 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Susd5G3UW60 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Susd5G3UW60 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Susd5G3UW60 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Susd5G3UW60 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Susd5G3UW60 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Susd5G3UW60 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Susd5G3UW60 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Susd5G3UW60 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Susd5G3UW60 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Susd5G3UW60 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Susd5G3UW60 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Susd5G3UW60 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Susd5G3UW60 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Susd5G3UW60 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Susd5G3UW60 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Susd5G3UW60 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Susd5G3UW60 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Susd5G3UW60 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Susd5G3UW60 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Susd5G3UW60 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Susd5G3UW60 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Susd5G3UW60 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Susd5G3UW60 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Susd5G3UW60 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Susd5G3UW60 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Susd5G3UW60 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Susd5G3UW60 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Susd5G3UW60 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Susd5G3UW60 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Susd5G3UW60 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Susd5G3UW60 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Susd5G3UW60 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Susd5G3UW60 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Susd5G3UW60 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Susd5G3UW60 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Susd5G3UW60 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Susd5G3UW60 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Susd5G3UW60 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Susd5G3UW60 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Susd5G3UW60 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Susd5G3UW60 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Susd5G3UW60 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Susd5G3UW60 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Susd5G3UW60 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Susd5G3UW60 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Susd5G3UW60 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Susd5G3UW60 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Susd5G3UW60 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Susd5G3UW60 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Susd5G3UW60 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Susd5G3UW60 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Susd5G3UW60 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Susd5G3UW60 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Susd5G3UW60 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Susd5G3UW60 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Susd5G3UW60 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Susd5G3UW60 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Susd5G3UW60 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Susd5G3UW60 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Susd5G3UW60 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Susd5G3UW60 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Susd5G3UW60 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Susd5G3UW60 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Susd5G3UW60 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Susd5G3UW60 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Susd5G3UW60 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Susd5G3UW60 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Susd5G3UW60 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Susd5G3UW60 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Susd5G3UW60 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Susd5G3UW60 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Susd5G3UW60 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Susd5G3UW60 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Susd5G3UW60 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Susd5G3UW60 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Susd5G3UW60 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Susd5G3UW60 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Susd5G3UW60 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Susd5G3UW60 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Susd5G3UW60 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Susd5G3UW60 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms