Protein–RNA interactions for Protein: F8VPY8

Colca2, COLCA2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colca2F8VPY8 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Colca2F8VPY8 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Colca2F8VPY8 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Colca2F8VPY8 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Colca2F8VPY8 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Colca2F8VPY8 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Colca2F8VPY8 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Colca2F8VPY8 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Colca2F8VPY8 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Colca2F8VPY8 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Colca2F8VPY8 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Colca2F8VPY8 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Colca2F8VPY8 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Colca2F8VPY8 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Colca2F8VPY8 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Colca2F8VPY8 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Colca2F8VPY8 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Colca2F8VPY8 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Colca2F8VPY8 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Colca2F8VPY8 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Colca2F8VPY8 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Colca2F8VPY8 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Colca2F8VPY8 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Colca2F8VPY8 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Colca2F8VPY8 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Colca2F8VPY8 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Colca2F8VPY8 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Colca2F8VPY8 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Colca2F8VPY8 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Colca2F8VPY8 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Colca2F8VPY8 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Colca2F8VPY8 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Colca2F8VPY8 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Colca2F8VPY8 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Colca2F8VPY8 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Colca2F8VPY8 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Colca2F8VPY8 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Colca2F8VPY8 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Colca2F8VPY8 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Colca2F8VPY8 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Colca2F8VPY8 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Colca2F8VPY8 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Colca2F8VPY8 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Colca2F8VPY8 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Colca2F8VPY8 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Colca2F8VPY8 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Colca2F8VPY8 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Colca2F8VPY8 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Colca2F8VPY8 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Colca2F8VPY8 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Colca2F8VPY8 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Colca2F8VPY8 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Colca2F8VPY8 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Colca2F8VPY8 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Colca2F8VPY8 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Colca2F8VPY8 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Colca2F8VPY8 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Colca2F8VPY8 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Colca2F8VPY8 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Colca2F8VPY8 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Colca2F8VPY8 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Colca2F8VPY8 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Colca2F8VPY8 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Colca2F8VPY8 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Colca2F8VPY8 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Colca2F8VPY8 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Colca2F8VPY8 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Colca2F8VPY8 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Colca2F8VPY8 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Colca2F8VPY8 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Colca2F8VPY8 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Colca2F8VPY8 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Colca2F8VPY8 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Colca2F8VPY8 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Colca2F8VPY8 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Colca2F8VPY8 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Colca2F8VPY8 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Colca2F8VPY8 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Colca2F8VPY8 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Colca2F8VPY8 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Colca2F8VPY8 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Colca2F8VPY8 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Colca2F8VPY8 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Colca2F8VPY8 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Colca2F8VPY8 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Colca2F8VPY8 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Colca2F8VPY8 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Colca2F8VPY8 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Colca2F8VPY8 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Colca2F8VPY8 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Colca2F8VPY8 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Colca2F8VPY8 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Colca2F8VPY8 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Colca2F8VPY8 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Colca2F8VPY8 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Colca2F8VPY8 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Colca2F8VPY8 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Colca2F8VPY8 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Colca2F8VPY8 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Colca2F8VPY8 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms