Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU2

Farp1, FERM, ARHGEF and pleckstrin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Farp1F8VPU2 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Farp1F8VPU2 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Farp1F8VPU2 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Farp1F8VPU2 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Farp1F8VPU2 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Farp1F8VPU2 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Farp1F8VPU2 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Farp1F8VPU2 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Farp1F8VPU2 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Farp1F8VPU2 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Farp1F8VPU2 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Farp1F8VPU2 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Farp1F8VPU2 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Farp1F8VPU2 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Farp1F8VPU2 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Farp1F8VPU2 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Farp1F8VPU2 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Farp1F8VPU2 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Farp1F8VPU2 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Farp1F8VPU2 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Farp1F8VPU2 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Farp1F8VPU2 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Farp1F8VPU2 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Farp1F8VPU2 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Farp1F8VPU2 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Farp1F8VPU2 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Farp1F8VPU2 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Farp1F8VPU2 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Farp1F8VPU2 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Farp1F8VPU2 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Farp1F8VPU2 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Farp1F8VPU2 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Farp1F8VPU2 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Farp1F8VPU2 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Farp1F8VPU2 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Farp1F8VPU2 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Farp1F8VPU2 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Farp1F8VPU2 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Farp1F8VPU2 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Farp1F8VPU2 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Farp1F8VPU2 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Farp1F8VPU2 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Farp1F8VPU2 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Farp1F8VPU2 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Farp1F8VPU2 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Farp1F8VPU2 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Farp1F8VPU2 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Farp1F8VPU2 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Farp1F8VPU2 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Farp1F8VPU2 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Farp1F8VPU2 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Farp1F8VPU2 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Farp1F8VPU2 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Farp1F8VPU2 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Farp1F8VPU2 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Farp1F8VPU2 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Farp1F8VPU2 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Farp1F8VPU2 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Farp1F8VPU2 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Farp1F8VPU2 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Farp1F8VPU2 4931428L18Rik-202ENSMUST00000135245 889 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Farp1F8VPU2 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Farp1F8VPU2 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Farp1F8VPU2 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Farp1F8VPU2 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Farp1F8VPU2 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Farp1F8VPU2 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Farp1F8VPU2 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Farp1F8VPU2 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Farp1F8VPU2 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Farp1F8VPU2 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Farp1F8VPU2 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Farp1F8VPU2 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Farp1F8VPU2 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Farp1F8VPU2 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Farp1F8VPU2 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Farp1F8VPU2 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Farp1F8VPU2 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Farp1F8VPU2 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Farp1F8VPU2 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Farp1F8VPU2 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Farp1F8VPU2 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Farp1F8VPU2 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Farp1F8VPU2 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Farp1F8VPU2 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Farp1F8VPU2 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Farp1F8VPU2 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Farp1F8VPU2 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Farp1F8VPU2 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Farp1F8VPU2 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Farp1F8VPU2 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Farp1F8VPU2 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Farp1F8VPU2 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Farp1F8VPU2 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Farp1F8VPU2 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Farp1F8VPU2 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Farp1F8VPU2 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Farp1F8VPU2 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Farp1F8VPU2 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Farp1F8VPU2 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms