Protein–RNA interactions for Protein: F8VPT3

Lct, Lactase, mousemouse

Predictions only

Length 1,931 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LctF8VPT3 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LctF8VPT3 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LctF8VPT3 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LctF8VPT3 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LctF8VPT3 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
LctF8VPT3 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LctF8VPT3 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LctF8VPT3 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LctF8VPT3 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LctF8VPT3 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LctF8VPT3 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LctF8VPT3 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LctF8VPT3 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LctF8VPT3 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LctF8VPT3 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LctF8VPT3 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LctF8VPT3 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
LctF8VPT3 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LctF8VPT3 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LctF8VPT3 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LctF8VPT3 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LctF8VPT3 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LctF8VPT3 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LctF8VPT3 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LctF8VPT3 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LctF8VPT3 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LctF8VPT3 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
LctF8VPT3 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LctF8VPT3 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LctF8VPT3 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
LctF8VPT3 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LctF8VPT3 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LctF8VPT3 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LctF8VPT3 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LctF8VPT3 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LctF8VPT3 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LctF8VPT3 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LctF8VPT3 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LctF8VPT3 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LctF8VPT3 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LctF8VPT3 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LctF8VPT3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
LctF8VPT3 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LctF8VPT3 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LctF8VPT3 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LctF8VPT3 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
LctF8VPT3 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LctF8VPT3 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LctF8VPT3 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LctF8VPT3 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LctF8VPT3 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LctF8VPT3 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LctF8VPT3 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LctF8VPT3 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LctF8VPT3 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
LctF8VPT3 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LctF8VPT3 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
LctF8VPT3 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
LctF8VPT3 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LctF8VPT3 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LctF8VPT3 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
LctF8VPT3 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LctF8VPT3 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LctF8VPT3 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LctF8VPT3 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LctF8VPT3 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LctF8VPT3 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LctF8VPT3 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LctF8VPT3 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LctF8VPT3 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LctF8VPT3 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LctF8VPT3 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LctF8VPT3 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LctF8VPT3 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LctF8VPT3 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LctF8VPT3 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
LctF8VPT3 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LctF8VPT3 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LctF8VPT3 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LctF8VPT3 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LctF8VPT3 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LctF8VPT3 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LctF8VPT3 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LctF8VPT3 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
LctF8VPT3 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LctF8VPT3 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LctF8VPT3 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
LctF8VPT3 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LctF8VPT3 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
LctF8VPT3 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LctF8VPT3 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
LctF8VPT3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
LctF8VPT3 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LctF8VPT3 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LctF8VPT3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LctF8VPT3 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LctF8VPT3 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LctF8VPT3 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LctF8VPT3 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LctF8VPT3 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms