Protein–RNA interactions for Protein: F6XLV1

Crocc2, Ciliary rootlet coiled-coil, rootletin family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crocc2F6XLV1 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Crocc2F6XLV1 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Crocc2F6XLV1 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Crocc2F6XLV1 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Crocc2F6XLV1 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Crocc2F6XLV1 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Crocc2F6XLV1 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Crocc2F6XLV1 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Crocc2F6XLV1 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Crocc2F6XLV1 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Crocc2F6XLV1 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Crocc2F6XLV1 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Crocc2F6XLV1 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Crocc2F6XLV1 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Crocc2F6XLV1 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Crocc2F6XLV1 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Crocc2F6XLV1 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Crocc2F6XLV1 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Crocc2F6XLV1 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Crocc2F6XLV1 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Crocc2F6XLV1 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Crocc2F6XLV1 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Crocc2F6XLV1 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Crocc2F6XLV1 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Crocc2F6XLV1 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Crocc2F6XLV1 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Crocc2F6XLV1 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Crocc2F6XLV1 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Crocc2F6XLV1 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Crocc2F6XLV1 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Crocc2F6XLV1 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Crocc2F6XLV1 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Crocc2F6XLV1 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Crocc2F6XLV1 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Crocc2F6XLV1 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Crocc2F6XLV1 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Crocc2F6XLV1 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Crocc2F6XLV1 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Crocc2F6XLV1 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Crocc2F6XLV1 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Crocc2F6XLV1 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Crocc2F6XLV1 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Crocc2F6XLV1 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Crocc2F6XLV1 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Crocc2F6XLV1 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Crocc2F6XLV1 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Crocc2F6XLV1 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Crocc2F6XLV1 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Crocc2F6XLV1 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Crocc2F6XLV1 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Crocc2F6XLV1 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Crocc2F6XLV1 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Crocc2F6XLV1 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Crocc2F6XLV1 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Crocc2F6XLV1 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Crocc2F6XLV1 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Crocc2F6XLV1 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Crocc2F6XLV1 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Crocc2F6XLV1 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Crocc2F6XLV1 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Crocc2F6XLV1 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Crocc2F6XLV1 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Crocc2F6XLV1 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Crocc2F6XLV1 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Crocc2F6XLV1 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Crocc2F6XLV1 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Crocc2F6XLV1 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Crocc2F6XLV1 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Crocc2F6XLV1 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Crocc2F6XLV1 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Crocc2F6XLV1 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Crocc2F6XLV1 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Crocc2F6XLV1 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Crocc2F6XLV1 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Crocc2F6XLV1 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Crocc2F6XLV1 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Crocc2F6XLV1 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Crocc2F6XLV1 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Crocc2F6XLV1 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Crocc2F6XLV1 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Crocc2F6XLV1 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Crocc2F6XLV1 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Crocc2F6XLV1 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Crocc2F6XLV1 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Crocc2F6XLV1 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Crocc2F6XLV1 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Crocc2F6XLV1 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Crocc2F6XLV1 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Crocc2F6XLV1 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Crocc2F6XLV1 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Crocc2F6XLV1 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Crocc2F6XLV1 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Crocc2F6XLV1 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Crocc2F6XLV1 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Crocc2F6XLV1 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Crocc2F6XLV1 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Crocc2F6XLV1 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Crocc2F6XLV1 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Crocc2F6XLV1 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Crocc2F6XLV1 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms