Protein–RNA interactions for Protein: F6U473

Gm28305, Predicted gene 28305 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28305F6U473 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm28305F6U473 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm28305F6U473 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm28305F6U473 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm28305F6U473 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm28305F6U473 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm28305F6U473 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm28305F6U473 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm28305F6U473 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm28305F6U473 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm28305F6U473 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm28305F6U473 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm28305F6U473 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm28305F6U473 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm28305F6U473 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm28305F6U473 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm28305F6U473 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm28305F6U473 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm28305F6U473 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm28305F6U473 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm28305F6U473 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm28305F6U473 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm28305F6U473 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm28305F6U473 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm28305F6U473 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm28305F6U473 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm28305F6U473 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm28305F6U473 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm28305F6U473 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm28305F6U473 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm28305F6U473 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm28305F6U473 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Gm28305F6U473 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.39
Gm28305F6U473 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm28305F6U473 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm28305F6U473 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm28305F6U473 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm28305F6U473 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm28305F6U473 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm28305F6U473 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm28305F6U473 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm28305F6U473 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm28305F6U473 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm28305F6U473 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm28305F6U473 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm28305F6U473 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm28305F6U473 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm28305F6U473 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm28305F6U473 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm28305F6U473 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm28305F6U473 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm28305F6U473 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm28305F6U473 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm28305F6U473 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm28305F6U473 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm28305F6U473 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm28305F6U473 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm28305F6U473 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm28305F6U473 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm28305F6U473 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm28305F6U473 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm28305F6U473 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm28305F6U473 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm28305F6U473 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm28305F6U473 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm28305F6U473 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm28305F6U473 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm28305F6U473 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm28305F6U473 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm28305F6U473 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm28305F6U473 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm28305F6U473 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm28305F6U473 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm28305F6U473 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm28305F6U473 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm28305F6U473 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm28305F6U473 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm28305F6U473 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm28305F6U473 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm28305F6U473 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm28305F6U473 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm28305F6U473 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm28305F6U473 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm28305F6U473 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm28305F6U473 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm28305F6U473 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm28305F6U473 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm28305F6U473 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm28305F6U473 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm28305F6U473 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm28305F6U473 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm28305F6U473 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm28305F6U473 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm28305F6U473 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm28305F6U473 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm28305F6U473 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm28305F6U473 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm28305F6U473 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm28305F6U473 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm28305F6U473 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms