Protein–RNA interactions for Protein: E9Q8N6

Aknad1, AKNA domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 675 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aknad1E9Q8N6 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Aknad1E9Q8N6 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Aknad1E9Q8N6 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Aknad1E9Q8N6 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Aknad1E9Q8N6 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Aknad1E9Q8N6 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Aknad1E9Q8N6 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Aknad1E9Q8N6 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Aknad1E9Q8N6 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Aknad1E9Q8N6 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Aknad1E9Q8N6 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Aknad1E9Q8N6 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Aknad1E9Q8N6 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Aknad1E9Q8N6 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Aknad1E9Q8N6 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Aknad1E9Q8N6 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Aknad1E9Q8N6 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Aknad1E9Q8N6 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Aknad1E9Q8N6 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Aknad1E9Q8N6 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Aknad1E9Q8N6 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Aknad1E9Q8N6 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Aknad1E9Q8N6 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Aknad1E9Q8N6 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Aknad1E9Q8N6 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Aknad1E9Q8N6 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Aknad1E9Q8N6 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Aknad1E9Q8N6 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Aknad1E9Q8N6 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Aknad1E9Q8N6 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Aknad1E9Q8N6 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Aknad1E9Q8N6 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Aknad1E9Q8N6 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Aknad1E9Q8N6 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Aknad1E9Q8N6 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Aknad1E9Q8N6 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Aknad1E9Q8N6 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Aknad1E9Q8N6 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Aknad1E9Q8N6 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Aknad1E9Q8N6 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Aknad1E9Q8N6 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Aknad1E9Q8N6 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Aknad1E9Q8N6 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Aknad1E9Q8N6 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Aknad1E9Q8N6 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Aknad1E9Q8N6 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Aknad1E9Q8N6 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Aknad1E9Q8N6 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Aknad1E9Q8N6 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Aknad1E9Q8N6 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Aknad1E9Q8N6 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Aknad1E9Q8N6 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Aknad1E9Q8N6 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Aknad1E9Q8N6 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Aknad1E9Q8N6 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Aknad1E9Q8N6 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Aknad1E9Q8N6 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Aknad1E9Q8N6 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Aknad1E9Q8N6 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Aknad1E9Q8N6 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Aknad1E9Q8N6 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Aknad1E9Q8N6 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Aknad1E9Q8N6 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Aknad1E9Q8N6 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Aknad1E9Q8N6 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Aknad1E9Q8N6 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Aknad1E9Q8N6 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Aknad1E9Q8N6 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Aknad1E9Q8N6 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Aknad1E9Q8N6 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Aknad1E9Q8N6 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Aknad1E9Q8N6 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Aknad1E9Q8N6 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Aknad1E9Q8N6 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Aknad1E9Q8N6 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Aknad1E9Q8N6 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Aknad1E9Q8N6 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Aknad1E9Q8N6 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Aknad1E9Q8N6 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Aknad1E9Q8N6 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Aknad1E9Q8N6 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Aknad1E9Q8N6 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Aknad1E9Q8N6 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Aknad1E9Q8N6 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Aknad1E9Q8N6 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Aknad1E9Q8N6 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Aknad1E9Q8N6 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Aknad1E9Q8N6 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Aknad1E9Q8N6 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Aknad1E9Q8N6 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Aknad1E9Q8N6 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Aknad1E9Q8N6 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Aknad1E9Q8N6 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Aknad1E9Q8N6 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Aknad1E9Q8N6 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Aknad1E9Q8N6 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Aknad1E9Q8N6 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Aknad1E9Q8N6 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Aknad1E9Q8N6 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Aknad1E9Q8N6 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms