Protein–RNA interactions for Protein: E9Q557

Dsp, Desmoplakin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,883 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DspE9Q557 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DspE9Q557 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DspE9Q557 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DspE9Q557 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DspE9Q557 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DspE9Q557 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DspE9Q557 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DspE9Q557 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DspE9Q557 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DspE9Q557 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DspE9Q557 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DspE9Q557 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DspE9Q557 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DspE9Q557 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DspE9Q557 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
DspE9Q557 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DspE9Q557 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DspE9Q557 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DspE9Q557 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DspE9Q557 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DspE9Q557 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
DspE9Q557 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DspE9Q557 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DspE9Q557 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DspE9Q557 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DspE9Q557 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DspE9Q557 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DspE9Q557 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DspE9Q557 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DspE9Q557 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DspE9Q557 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DspE9Q557 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DspE9Q557 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DspE9Q557 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DspE9Q557 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DspE9Q557 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DspE9Q557 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DspE9Q557 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DspE9Q557 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DspE9Q557 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DspE9Q557 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DspE9Q557 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DspE9Q557 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DspE9Q557 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DspE9Q557 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DspE9Q557 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DspE9Q557 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DspE9Q557 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DspE9Q557 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DspE9Q557 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DspE9Q557 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DspE9Q557 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DspE9Q557 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DspE9Q557 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DspE9Q557 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DspE9Q557 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DspE9Q557 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DspE9Q557 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DspE9Q557 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
DspE9Q557 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DspE9Q557 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DspE9Q557 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DspE9Q557 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DspE9Q557 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DspE9Q557 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DspE9Q557 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DspE9Q557 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DspE9Q557 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DspE9Q557 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DspE9Q557 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DspE9Q557 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DspE9Q557 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DspE9Q557 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DspE9Q557 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DspE9Q557 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DspE9Q557 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DspE9Q557 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DspE9Q557 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
DspE9Q557 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
DspE9Q557 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DspE9Q557 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DspE9Q557 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DspE9Q557 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DspE9Q557 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DspE9Q557 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DspE9Q557 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DspE9Q557 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
DspE9Q557 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
DspE9Q557 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
DspE9Q557 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
DspE9Q557 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
DspE9Q557 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
DspE9Q557 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
DspE9Q557 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
DspE9Q557 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DspE9Q557 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DspE9Q557 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DspE9Q557 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DspE9Q557 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DspE9Q557 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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