Protein–RNA interactions for Protein: E9Q512

Trip11, Thyroid hormone receptor interactor 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip11E9Q512 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trip11E9Q512 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trip11E9Q512 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trip11E9Q512 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trip11E9Q512 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trip11E9Q512 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trip11E9Q512 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trip11E9Q512 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trip11E9Q512 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trip11E9Q512 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trip11E9Q512 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trip11E9Q512 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trip11E9Q512 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trip11E9Q512 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trip11E9Q512 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trip11E9Q512 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trip11E9Q512 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trip11E9Q512 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trip11E9Q512 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trip11E9Q512 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trip11E9Q512 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trip11E9Q512 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trip11E9Q512 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trip11E9Q512 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trip11E9Q512 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trip11E9Q512 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Trip11E9Q512 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trip11E9Q512 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trip11E9Q512 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trip11E9Q512 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trip11E9Q512 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trip11E9Q512 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trip11E9Q512 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trip11E9Q512 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trip11E9Q512 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trip11E9Q512 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Trip11E9Q512 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trip11E9Q512 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trip11E9Q512 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trip11E9Q512 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trip11E9Q512 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trip11E9Q512 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trip11E9Q512 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trip11E9Q512 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trip11E9Q512 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trip11E9Q512 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trip11E9Q512 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trip11E9Q512 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trip11E9Q512 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trip11E9Q512 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trip11E9Q512 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trip11E9Q512 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trip11E9Q512 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Trip11E9Q512 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trip11E9Q512 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trip11E9Q512 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trip11E9Q512 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Trip11E9Q512 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Trip11E9Q512 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trip11E9Q512 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Trip11E9Q512 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trip11E9Q512 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trip11E9Q512 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trip11E9Q512 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trip11E9Q512 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trip11E9Q512 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trip11E9Q512 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trip11E9Q512 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trip11E9Q512 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trip11E9Q512 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trip11E9Q512 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trip11E9Q512 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trip11E9Q512 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trip11E9Q512 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trip11E9Q512 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trip11E9Q512 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trip11E9Q512 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trip11E9Q512 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trip11E9Q512 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Trip11E9Q512 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trip11E9Q512 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trip11E9Q512 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trip11E9Q512 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trip11E9Q512 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trip11E9Q512 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trip11E9Q512 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Trip11E9Q512 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trip11E9Q512 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trip11E9Q512 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trip11E9Q512 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trip11E9Q512 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trip11E9Q512 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trip11E9Q512 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trip11E9Q512 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trip11E9Q512 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trip11E9Q512 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trip11E9Q512 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trip11E9Q512 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trip11E9Q512 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Trip11E9Q512 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms