Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1W3

Neb, Nebulin, mousemouse

Predictions only

Length 7,152 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NebE9Q1W3 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Hspb11-201ENSMUST00000046558 608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
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