Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M1

Pdzd2, PDZ domain-containing 2, mousemouse

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Length 2,796 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd2E9Q1M1 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pdzd2E9Q1M1 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pdzd2E9Q1M1 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pdzd2E9Q1M1 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pdzd2E9Q1M1 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pdzd2E9Q1M1 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pdzd2E9Q1M1 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pdzd2E9Q1M1 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pdzd2E9Q1M1 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pdzd2E9Q1M1 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Pdzd2E9Q1M1 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pdzd2E9Q1M1 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pdzd2E9Q1M1 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pdzd2E9Q1M1 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pdzd2E9Q1M1 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pdzd2E9Q1M1 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pdzd2E9Q1M1 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pdzd2E9Q1M1 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pdzd2E9Q1M1 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pdzd2E9Q1M1 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pdzd2E9Q1M1 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pdzd2E9Q1M1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pdzd2E9Q1M1 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pdzd2E9Q1M1 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pdzd2E9Q1M1 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pdzd2E9Q1M1 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pdzd2E9Q1M1 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pdzd2E9Q1M1 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pdzd2E9Q1M1 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pdzd2E9Q1M1 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pdzd2E9Q1M1 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pdzd2E9Q1M1 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pdzd2E9Q1M1 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pdzd2E9Q1M1 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pdzd2E9Q1M1 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pdzd2E9Q1M1 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pdzd2E9Q1M1 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Pdzd2E9Q1M1 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Pdzd2E9Q1M1 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pdzd2E9Q1M1 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Pdzd2E9Q1M1 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pdzd2E9Q1M1 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pdzd2E9Q1M1 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pdzd2E9Q1M1 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pdzd2E9Q1M1 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pdzd2E9Q1M1 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pdzd2E9Q1M1 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pdzd2E9Q1M1 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pdzd2E9Q1M1 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Pdzd2E9Q1M1 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pdzd2E9Q1M1 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pdzd2E9Q1M1 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pdzd2E9Q1M1 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pdzd2E9Q1M1 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pdzd2E9Q1M1 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pdzd2E9Q1M1 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pdzd2E9Q1M1 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pdzd2E9Q1M1 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pdzd2E9Q1M1 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pdzd2E9Q1M1 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Pdzd2E9Q1M1 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pdzd2E9Q1M1 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pdzd2E9Q1M1 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pdzd2E9Q1M1 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pdzd2E9Q1M1 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pdzd2E9Q1M1 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pdzd2E9Q1M1 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pdzd2E9Q1M1 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pdzd2E9Q1M1 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pdzd2E9Q1M1 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Pdzd2E9Q1M1 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Pdzd2E9Q1M1 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
Pdzd2E9Q1M1 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
Pdzd2E9Q1M1 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Pdzd2E9Q1M1 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pdzd2E9Q1M1 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pdzd2E9Q1M1 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pdzd2E9Q1M1 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pdzd2E9Q1M1 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pdzd2E9Q1M1 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pdzd2E9Q1M1 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pdzd2E9Q1M1 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pdzd2E9Q1M1 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pdzd2E9Q1M1 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Pdzd2E9Q1M1 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Pdzd2E9Q1M1 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pdzd2E9Q1M1 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pdzd2E9Q1M1 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pdzd2E9Q1M1 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pdzd2E9Q1M1 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pdzd2E9Q1M1 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pdzd2E9Q1M1 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pdzd2E9Q1M1 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pdzd2E9Q1M1 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pdzd2E9Q1M1 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pdzd2E9Q1M1 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Pdzd2E9Q1M1 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pdzd2E9Q1M1 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pdzd2E9Q1M1 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pdzd2E9Q1M1 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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