Protein–RNA interactions for Protein: E9Q166

Atad2b, ATPase family, AAA domain-containing 2B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atad2bE9Q166 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Atad2bE9Q166 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Atad2bE9Q166 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Atad2bE9Q166 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
Atad2bE9Q166 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Atad2bE9Q166 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Atad2bE9Q166 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Atad2bE9Q166 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Atad2bE9Q166 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Atad2bE9Q166 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Atad2bE9Q166 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Atad2bE9Q166 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Atad2bE9Q166 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Atad2bE9Q166 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Atad2bE9Q166 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Atad2bE9Q166 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Atad2bE9Q166 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Atad2bE9Q166 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
Atad2bE9Q166 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
Atad2bE9Q166 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Atad2bE9Q166 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Atad2bE9Q166 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Atad2bE9Q166 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Atad2bE9Q166 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
Atad2bE9Q166 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Atad2bE9Q166 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
Atad2bE9Q166 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Atad2bE9Q166 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Atad2bE9Q166 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Atad2bE9Q166 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Atad2bE9Q166 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Atad2bE9Q166 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Atad2bE9Q166 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Atad2bE9Q166 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Atad2bE9Q166 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
Atad2bE9Q166 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Atad2bE9Q166 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
Atad2bE9Q166 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Atad2bE9Q166 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Atad2bE9Q166 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Atad2bE9Q166 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Atad2bE9Q166 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Atad2bE9Q166 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Atad2bE9Q166 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Atad2bE9Q166 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
Atad2bE9Q166 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Atad2bE9Q166 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Atad2bE9Q166 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Atad2bE9Q166 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Atad2bE9Q166 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Atad2bE9Q166 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
Atad2bE9Q166 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Atad2bE9Q166 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Atad2bE9Q166 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Atad2bE9Q166 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Atad2bE9Q166 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Atad2bE9Q166 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Atad2bE9Q166 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Atad2bE9Q166 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Atad2bE9Q166 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Atad2bE9Q166 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Atad2bE9Q166 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Atad2bE9Q166 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Atad2bE9Q166 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Atad2bE9Q166 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Atad2bE9Q166 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Atad2bE9Q166 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Atad2bE9Q166 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
Atad2bE9Q166 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Atad2bE9Q166 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Atad2bE9Q166 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Atad2bE9Q166 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Atad2bE9Q166 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Atad2bE9Q166 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Atad2bE9Q166 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Atad2bE9Q166 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Atad2bE9Q166 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
Atad2bE9Q166 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Atad2bE9Q166 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Atad2bE9Q166 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Atad2bE9Q166 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Atad2bE9Q166 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Atad2bE9Q166 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Atad2bE9Q166 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
Atad2bE9Q166 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Atad2bE9Q166 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Atad2bE9Q166 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Atad2bE9Q166 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Atad2bE9Q166 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Atad2bE9Q166 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Atad2bE9Q166 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Atad2bE9Q166 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Atad2bE9Q166 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Atad2bE9Q166 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Atad2bE9Q166 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Atad2bE9Q166 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Atad2bE9Q166 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Atad2bE9Q166 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Atad2bE9Q166 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Atad2bE9Q166 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms