Protein–RNA interactions for Protein: E9PZM7

Scaf11, SR-related CTD-associated factor 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf11E9PZM7 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Scaf11E9PZM7 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Scaf11E9PZM7 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Scaf11E9PZM7 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Scaf11E9PZM7 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Scaf11E9PZM7 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Scaf11E9PZM7 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Scaf11E9PZM7 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Scaf11E9PZM7 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Scaf11E9PZM7 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Scaf11E9PZM7 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Scaf11E9PZM7 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Scaf11E9PZM7 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Scaf11E9PZM7 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Scaf11E9PZM7 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Scaf11E9PZM7 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Scaf11E9PZM7 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Scaf11E9PZM7 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Scaf11E9PZM7 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Scaf11E9PZM7 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Scaf11E9PZM7 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Scaf11E9PZM7 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Scaf11E9PZM7 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Scaf11E9PZM7 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Scaf11E9PZM7 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Scaf11E9PZM7 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Scaf11E9PZM7 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Scaf11E9PZM7 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Scaf11E9PZM7 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Scaf11E9PZM7 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Scaf11E9PZM7 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Scaf11E9PZM7 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Scaf11E9PZM7 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Scaf11E9PZM7 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Scaf11E9PZM7 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Scaf11E9PZM7 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Scaf11E9PZM7 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Scaf11E9PZM7 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Scaf11E9PZM7 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Scaf11E9PZM7 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Scaf11E9PZM7 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Scaf11E9PZM7 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Scaf11E9PZM7 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Scaf11E9PZM7 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Scaf11E9PZM7 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Scaf11E9PZM7 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Scaf11E9PZM7 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Scaf11E9PZM7 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Scaf11E9PZM7 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Scaf11E9PZM7 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Scaf11E9PZM7 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Scaf11E9PZM7 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Scaf11E9PZM7 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Scaf11E9PZM7 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Scaf11E9PZM7 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Scaf11E9PZM7 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Scaf11E9PZM7 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Scaf11E9PZM7 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Scaf11E9PZM7 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Scaf11E9PZM7 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Scaf11E9PZM7 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Scaf11E9PZM7 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Scaf11E9PZM7 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Scaf11E9PZM7 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Scaf11E9PZM7 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Scaf11E9PZM7 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Scaf11E9PZM7 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Scaf11E9PZM7 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Scaf11E9PZM7 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Scaf11E9PZM7 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Scaf11E9PZM7 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Scaf11E9PZM7 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Scaf11E9PZM7 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Scaf11E9PZM7 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Scaf11E9PZM7 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Scaf11E9PZM7 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Scaf11E9PZM7 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Scaf11E9PZM7 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Scaf11E9PZM7 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Scaf11E9PZM7 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Scaf11E9PZM7 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Scaf11E9PZM7 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Scaf11E9PZM7 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Scaf11E9PZM7 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Scaf11E9PZM7 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Scaf11E9PZM7 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Scaf11E9PZM7 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Scaf11E9PZM7 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Scaf11E9PZM7 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Scaf11E9PZM7 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Scaf11E9PZM7 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Scaf11E9PZM7 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Scaf11E9PZM7 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Scaf11E9PZM7 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Scaf11E9PZM7 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Scaf11E9PZM7 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Scaf11E9PZM7 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Scaf11E9PZM7 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Scaf11E9PZM7 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Scaf11E9PZM7 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms