Protein–RNA interactions for Protein: E9PZM4

Chd2, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd2E9PZM4 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Chd2E9PZM4 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Chd2E9PZM4 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Chd2E9PZM4 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Chd2E9PZM4 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Chd2E9PZM4 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Chd2E9PZM4 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Chd2E9PZM4 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Chd2E9PZM4 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Chd2E9PZM4 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Chd2E9PZM4 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Chd2E9PZM4 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Chd2E9PZM4 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Chd2E9PZM4 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Chd2E9PZM4 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Chd2E9PZM4 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Chd2E9PZM4 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Chd2E9PZM4 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Chd2E9PZM4 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Chd2E9PZM4 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Chd2E9PZM4 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Chd2E9PZM4 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Chd2E9PZM4 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Chd2E9PZM4 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Chd2E9PZM4 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Chd2E9PZM4 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Chd2E9PZM4 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Chd2E9PZM4 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Chd2E9PZM4 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Chd2E9PZM4 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Chd2E9PZM4 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Chd2E9PZM4 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Chd2E9PZM4 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Chd2E9PZM4 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Chd2E9PZM4 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Chd2E9PZM4 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Chd2E9PZM4 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Chd2E9PZM4 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Chd2E9PZM4 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Chd2E9PZM4 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Chd2E9PZM4 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Chd2E9PZM4 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Chd2E9PZM4 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Chd2E9PZM4 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Chd2E9PZM4 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chd2E9PZM4 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chd2E9PZM4 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Chd2E9PZM4 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chd2E9PZM4 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chd2E9PZM4 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chd2E9PZM4 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chd2E9PZM4 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chd2E9PZM4 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chd2E9PZM4 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chd2E9PZM4 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chd2E9PZM4 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chd2E9PZM4 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chd2E9PZM4 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chd2E9PZM4 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chd2E9PZM4 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Chd2E9PZM4 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Chd2E9PZM4 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Chd2E9PZM4 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Chd2E9PZM4 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Chd2E9PZM4 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Chd2E9PZM4 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Chd2E9PZM4 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Chd2E9PZM4 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Chd2E9PZM4 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Chd2E9PZM4 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Chd2E9PZM4 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Chd2E9PZM4 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Chd2E9PZM4 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Chd2E9PZM4 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Chd2E9PZM4 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Chd2E9PZM4 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Chd2E9PZM4 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Chd2E9PZM4 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Chd2E9PZM4 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Chd2E9PZM4 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Chd2E9PZM4 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Chd2E9PZM4 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Chd2E9PZM4 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Chd2E9PZM4 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Chd2E9PZM4 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Chd2E9PZM4 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Chd2E9PZM4 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Chd2E9PZM4 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Chd2E9PZM4 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Chd2E9PZM4 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Chd2E9PZM4 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Chd2E9PZM4 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Chd2E9PZM4 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Chd2E9PZM4 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Chd2E9PZM4 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Chd2E9PZM4 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Chd2E9PZM4 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Chd2E9PZM4 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Chd2E9PZM4 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Chd2E9PZM4 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms