Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ26

Brd1, Bromodomain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd1E9PZ26 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Brd1E9PZ26 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Brd1E9PZ26 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Brd1E9PZ26 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Brd1E9PZ26 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Brd1E9PZ26 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Brd1E9PZ26 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Brd1E9PZ26 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Brd1E9PZ26 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Brd1E9PZ26 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Brd1E9PZ26 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Brd1E9PZ26 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Brd1E9PZ26 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Brd1E9PZ26 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Brd1E9PZ26 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Brd1E9PZ26 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Brd1E9PZ26 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Brd1E9PZ26 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Brd1E9PZ26 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Brd1E9PZ26 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Brd1E9PZ26 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Brd1E9PZ26 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Brd1E9PZ26 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Brd1E9PZ26 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Brd1E9PZ26 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Brd1E9PZ26 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Brd1E9PZ26 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Brd1E9PZ26 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Brd1E9PZ26 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Brd1E9PZ26 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Brd1E9PZ26 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Brd1E9PZ26 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Brd1E9PZ26 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Brd1E9PZ26 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Brd1E9PZ26 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Brd1E9PZ26 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Brd1E9PZ26 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Brd1E9PZ26 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Brd1E9PZ26 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Brd1E9PZ26 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Brd1E9PZ26 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Brd1E9PZ26 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Brd1E9PZ26 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Brd1E9PZ26 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Brd1E9PZ26 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Brd1E9PZ26 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Brd1E9PZ26 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Brd1E9PZ26 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Brd1E9PZ26 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Brd1E9PZ26 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Brd1E9PZ26 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Brd1E9PZ26 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Brd1E9PZ26 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Brd1E9PZ26 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Brd1E9PZ26 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Brd1E9PZ26 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Brd1E9PZ26 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Brd1E9PZ26 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Brd1E9PZ26 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Brd1E9PZ26 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Brd1E9PZ26 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Brd1E9PZ26 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Brd1E9PZ26 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Brd1E9PZ26 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Brd1E9PZ26 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Brd1E9PZ26 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Brd1E9PZ26 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Brd1E9PZ26 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Brd1E9PZ26 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Brd1E9PZ26 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Brd1E9PZ26 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Brd1E9PZ26 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Brd1E9PZ26 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Brd1E9PZ26 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Brd1E9PZ26 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Brd1E9PZ26 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Brd1E9PZ26 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Brd1E9PZ26 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Brd1E9PZ26 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Brd1E9PZ26 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Brd1E9PZ26 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Brd1E9PZ26 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Brd1E9PZ26 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Brd1E9PZ26 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Brd1E9PZ26 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Brd1E9PZ26 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Brd1E9PZ26 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Brd1E9PZ26 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Brd1E9PZ26 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Brd1E9PZ26 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Brd1E9PZ26 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Brd1E9PZ26 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Brd1E9PZ26 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Brd1E9PZ26 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Brd1E9PZ26 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Brd1E9PZ26 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Brd1E9PZ26 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Brd1E9PZ26 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Brd1E9PZ26 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Brd1E9PZ26 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms