Protein–RNA interactions for Protein: E9PWW9

Rsf1, Remodeling and spacing factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsf1E9PWW9 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Rsf1E9PWW9 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Rsf1E9PWW9 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Rsf1E9PWW9 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Rsf1E9PWW9 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Rsf1E9PWW9 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Rsf1E9PWW9 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Rsf1E9PWW9 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Rsf1E9PWW9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Rsf1E9PWW9 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Rsf1E9PWW9 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Rsf1E9PWW9 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Rsf1E9PWW9 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Rsf1E9PWW9 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Rsf1E9PWW9 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Rsf1E9PWW9 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Rsf1E9PWW9 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Rsf1E9PWW9 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Rsf1E9PWW9 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Rsf1E9PWW9 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Rsf1E9PWW9 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Rsf1E9PWW9 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Rsf1E9PWW9 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Rsf1E9PWW9 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Rsf1E9PWW9 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Rsf1E9PWW9 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Rsf1E9PWW9 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Rsf1E9PWW9 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Rsf1E9PWW9 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Rsf1E9PWW9 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Rsf1E9PWW9 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Rsf1E9PWW9 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Rsf1E9PWW9 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Rsf1E9PWW9 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Rsf1E9PWW9 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Rsf1E9PWW9 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Rsf1E9PWW9 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Rsf1E9PWW9 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Rsf1E9PWW9 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Rsf1E9PWW9 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Rsf1E9PWW9 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Rsf1E9PWW9 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Rsf1E9PWW9 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Rsf1E9PWW9 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Rsf1E9PWW9 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Rsf1E9PWW9 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Rsf1E9PWW9 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Rsf1E9PWW9 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Rsf1E9PWW9 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Rsf1E9PWW9 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Rsf1E9PWW9 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Rsf1E9PWW9 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Rsf1E9PWW9 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Rsf1E9PWW9 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Rsf1E9PWW9 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Rsf1E9PWW9 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Rsf1E9PWW9 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Rsf1E9PWW9 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Rsf1E9PWW9 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Rsf1E9PWW9 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Rsf1E9PWW9 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Rsf1E9PWW9 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Rsf1E9PWW9 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Rsf1E9PWW9 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Rsf1E9PWW9 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Rsf1E9PWW9 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Rsf1E9PWW9 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Rsf1E9PWW9 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Rsf1E9PWW9 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Rsf1E9PWW9 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Rsf1E9PWW9 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Rsf1E9PWW9 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Rsf1E9PWW9 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Rsf1E9PWW9 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Rsf1E9PWW9 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Rsf1E9PWW9 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Rsf1E9PWW9 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Rsf1E9PWW9 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Rsf1E9PWW9 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Rsf1E9PWW9 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Rsf1E9PWW9 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Rsf1E9PWW9 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Rsf1E9PWW9 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Rsf1E9PWW9 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Rsf1E9PWW9 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Rsf1E9PWW9 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Rsf1E9PWW9 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Rsf1E9PWW9 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Rsf1E9PWW9 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Rsf1E9PWW9 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Rsf1E9PWW9 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Rsf1E9PWW9 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Rsf1E9PWW9 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Rsf1E9PWW9 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Rsf1E9PWW9 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Rsf1E9PWW9 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Rsf1E9PWW9 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Rsf1E9PWW9 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Rsf1E9PWW9 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Rsf1E9PWW9 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms