Protein–RNA interactions for Protein: E9PVL6

Trim30b, Tripartite motif-containing 30B, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30bE9PVL6 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim30bE9PVL6 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim30bE9PVL6 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim30bE9PVL6 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim30bE9PVL6 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim30bE9PVL6 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim30bE9PVL6 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim30bE9PVL6 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim30bE9PVL6 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim30bE9PVL6 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim30bE9PVL6 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim30bE9PVL6 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim30bE9PVL6 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim30bE9PVL6 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim30bE9PVL6 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim30bE9PVL6 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim30bE9PVL6 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trim30bE9PVL6 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trim30bE9PVL6 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trim30bE9PVL6 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trim30bE9PVL6 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trim30bE9PVL6 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trim30bE9PVL6 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trim30bE9PVL6 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trim30bE9PVL6 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim30bE9PVL6 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim30bE9PVL6 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim30bE9PVL6 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim30bE9PVL6 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim30bE9PVL6 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim30bE9PVL6 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim30bE9PVL6 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim30bE9PVL6 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim30bE9PVL6 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim30bE9PVL6 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim30bE9PVL6 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim30bE9PVL6 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim30bE9PVL6 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim30bE9PVL6 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim30bE9PVL6 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim30bE9PVL6 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim30bE9PVL6 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim30bE9PVL6 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim30bE9PVL6 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim30bE9PVL6 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim30bE9PVL6 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim30bE9PVL6 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim30bE9PVL6 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim30bE9PVL6 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim30bE9PVL6 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim30bE9PVL6 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim30bE9PVL6 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim30bE9PVL6 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim30bE9PVL6 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim30bE9PVL6 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim30bE9PVL6 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim30bE9PVL6 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim30bE9PVL6 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim30bE9PVL6 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim30bE9PVL6 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim30bE9PVL6 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim30bE9PVL6 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim30bE9PVL6 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim30bE9PVL6 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim30bE9PVL6 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim30bE9PVL6 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim30bE9PVL6 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim30bE9PVL6 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim30bE9PVL6 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim30bE9PVL6 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim30bE9PVL6 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim30bE9PVL6 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim30bE9PVL6 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim30bE9PVL6 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim30bE9PVL6 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim30bE9PVL6 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim30bE9PVL6 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim30bE9PVL6 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim30bE9PVL6 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim30bE9PVL6 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim30bE9PVL6 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim30bE9PVL6 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim30bE9PVL6 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim30bE9PVL6 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim30bE9PVL6 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim30bE9PVL6 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim30bE9PVL6 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim30bE9PVL6 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim30bE9PVL6 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim30bE9PVL6 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim30bE9PVL6 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim30bE9PVL6 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim30bE9PVL6 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim30bE9PVL6 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim30bE9PVL6 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim30bE9PVL6 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim30bE9PVL6 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim30bE9PVL6 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim30bE9PVL6 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim30bE9PVL6 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms