Protein–RNA interactions for Protein: E9PUP1

Syde2, Synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans), mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde2E9PUP1 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Syde2E9PUP1 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Syde2E9PUP1 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Syde2E9PUP1 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Syde2E9PUP1 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Syde2E9PUP1 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Syde2E9PUP1 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Syde2E9PUP1 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Syde2E9PUP1 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Syde2E9PUP1 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Syde2E9PUP1 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Syde2E9PUP1 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Syde2E9PUP1 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Syde2E9PUP1 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Syde2E9PUP1 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Syde2E9PUP1 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Syde2E9PUP1 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Syde2E9PUP1 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Syde2E9PUP1 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Syde2E9PUP1 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Syde2E9PUP1 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Syde2E9PUP1 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Syde2E9PUP1 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Syde2E9PUP1 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Syde2E9PUP1 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Syde2E9PUP1 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Syde2E9PUP1 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Syde2E9PUP1 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Syde2E9PUP1 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Syde2E9PUP1 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Syde2E9PUP1 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Syde2E9PUP1 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Syde2E9PUP1 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Syde2E9PUP1 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Syde2E9PUP1 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Syde2E9PUP1 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Syde2E9PUP1 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Syde2E9PUP1 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Syde2E9PUP1 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Syde2E9PUP1 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Syde2E9PUP1 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Syde2E9PUP1 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Syde2E9PUP1 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Syde2E9PUP1 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Syde2E9PUP1 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Syde2E9PUP1 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Syde2E9PUP1 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Syde2E9PUP1 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Syde2E9PUP1 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Syde2E9PUP1 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Syde2E9PUP1 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Syde2E9PUP1 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Syde2E9PUP1 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Syde2E9PUP1 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Syde2E9PUP1 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Syde2E9PUP1 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Syde2E9PUP1 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Syde2E9PUP1 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Syde2E9PUP1 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Syde2E9PUP1 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Syde2E9PUP1 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Syde2E9PUP1 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Syde2E9PUP1 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Syde2E9PUP1 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Syde2E9PUP1 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Syde2E9PUP1 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Syde2E9PUP1 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Syde2E9PUP1 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Syde2E9PUP1 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Syde2E9PUP1 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Syde2E9PUP1 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Syde2E9PUP1 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Syde2E9PUP1 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Syde2E9PUP1 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Syde2E9PUP1 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Syde2E9PUP1 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Syde2E9PUP1 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Syde2E9PUP1 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Syde2E9PUP1 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Syde2E9PUP1 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Syde2E9PUP1 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Syde2E9PUP1 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Syde2E9PUP1 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Syde2E9PUP1 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Syde2E9PUP1 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Syde2E9PUP1 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Syde2E9PUP1 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Syde2E9PUP1 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Syde2E9PUP1 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Syde2E9PUP1 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Syde2E9PUP1 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Syde2E9PUP1 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Syde2E9PUP1 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Syde2E9PUP1 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Syde2E9PUP1 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Syde2E9PUP1 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Syde2E9PUP1 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Syde2E9PUP1 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Syde2E9PUP1 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Syde2E9PUP1 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms