Protein–RNA interactions for Protein: E1AZ71

Cngb1, Cyclic nucleotide-gated channel beta 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cngb1E1AZ71 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Cngb1E1AZ71 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Cngb1E1AZ71 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Cngb1E1AZ71 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Cngb1E1AZ71 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Cngb1E1AZ71 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Cngb1E1AZ71 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Cngb1E1AZ71 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Cngb1E1AZ71 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Cngb1E1AZ71 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Cngb1E1AZ71 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Cngb1E1AZ71 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Cngb1E1AZ71 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Cngb1E1AZ71 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Cngb1E1AZ71 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Cngb1E1AZ71 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Cngb1E1AZ71 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Cngb1E1AZ71 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Cngb1E1AZ71 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Cngb1E1AZ71 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Cngb1E1AZ71 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Cngb1E1AZ71 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Cngb1E1AZ71 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Cngb1E1AZ71 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Cngb1E1AZ71 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Cngb1E1AZ71 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Cngb1E1AZ71 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Cngb1E1AZ71 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Cngb1E1AZ71 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Cngb1E1AZ71 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Cngb1E1AZ71 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Cngb1E1AZ71 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Cngb1E1AZ71 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Cngb1E1AZ71 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Cngb1E1AZ71 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Cngb1E1AZ71 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Cngb1E1AZ71 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Cngb1E1AZ71 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Cngb1E1AZ71 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
Cngb1E1AZ71 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Cngb1E1AZ71 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Cngb1E1AZ71 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Cngb1E1AZ71 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Cngb1E1AZ71 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Cngb1E1AZ71 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Cngb1E1AZ71 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Cngb1E1AZ71 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Cngb1E1AZ71 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Cngb1E1AZ71 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Cngb1E1AZ71 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Cngb1E1AZ71 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Cngb1E1AZ71 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Cngb1E1AZ71 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Cngb1E1AZ71 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Cngb1E1AZ71 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Cngb1E1AZ71 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Cngb1E1AZ71 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Cngb1E1AZ71 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Cngb1E1AZ71 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Cngb1E1AZ71 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Cngb1E1AZ71 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Cngb1E1AZ71 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Cngb1E1AZ71 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Cngb1E1AZ71 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Cngb1E1AZ71 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Cngb1E1AZ71 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Cngb1E1AZ71 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Cngb1E1AZ71 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Cngb1E1AZ71 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Cngb1E1AZ71 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Cngb1E1AZ71 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Cngb1E1AZ71 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Cngb1E1AZ71 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Cngb1E1AZ71 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Cngb1E1AZ71 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Cngb1E1AZ71 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Cngb1E1AZ71 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Cngb1E1AZ71 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Cngb1E1AZ71 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Cngb1E1AZ71 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Cngb1E1AZ71 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Cngb1E1AZ71 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Cngb1E1AZ71 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Cngb1E1AZ71 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Cngb1E1AZ71 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Cngb1E1AZ71 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Cngb1E1AZ71 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Cngb1E1AZ71 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Cngb1E1AZ71 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Cngb1E1AZ71 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Cngb1E1AZ71 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Cngb1E1AZ71 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Cngb1E1AZ71 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Cngb1E1AZ71 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Cngb1E1AZ71 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Cngb1E1AZ71 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Cngb1E1AZ71 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Cngb1E1AZ71 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Cngb1E1AZ71 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Cngb1E1AZ71 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.8 ms