Protein–RNA interactions for Protein: D6MZJ6

Smpd5, MCG22096, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd5D6MZJ6 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smpd5D6MZJ6 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smpd5D6MZJ6 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smpd5D6MZJ6 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smpd5D6MZJ6 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smpd5D6MZJ6 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smpd5D6MZJ6 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smpd5D6MZJ6 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smpd5D6MZJ6 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smpd5D6MZJ6 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smpd5D6MZJ6 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smpd5D6MZJ6 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smpd5D6MZJ6 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smpd5D6MZJ6 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smpd5D6MZJ6 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smpd5D6MZJ6 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smpd5D6MZJ6 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smpd5D6MZJ6 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smpd5D6MZJ6 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smpd5D6MZJ6 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smpd5D6MZJ6 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smpd5D6MZJ6 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smpd5D6MZJ6 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Smpd5D6MZJ6 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smpd5D6MZJ6 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smpd5D6MZJ6 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smpd5D6MZJ6 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smpd5D6MZJ6 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smpd5D6MZJ6 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smpd5D6MZJ6 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smpd5D6MZJ6 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smpd5D6MZJ6 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Smpd5D6MZJ6 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smpd5D6MZJ6 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smpd5D6MZJ6 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smpd5D6MZJ6 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smpd5D6MZJ6 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smpd5D6MZJ6 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smpd5D6MZJ6 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smpd5D6MZJ6 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smpd5D6MZJ6 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smpd5D6MZJ6 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smpd5D6MZJ6 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smpd5D6MZJ6 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Smpd5D6MZJ6 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smpd5D6MZJ6 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smpd5D6MZJ6 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Smpd5D6MZJ6 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smpd5D6MZJ6 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smpd5D6MZJ6 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smpd5D6MZJ6 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smpd5D6MZJ6 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smpd5D6MZJ6 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smpd5D6MZJ6 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smpd5D6MZJ6 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smpd5D6MZJ6 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smpd5D6MZJ6 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smpd5D6MZJ6 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smpd5D6MZJ6 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smpd5D6MZJ6 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smpd5D6MZJ6 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smpd5D6MZJ6 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smpd5D6MZJ6 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smpd5D6MZJ6 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smpd5D6MZJ6 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smpd5D6MZJ6 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Smpd5D6MZJ6 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Smpd5D6MZJ6 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Smpd5D6MZJ6 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Smpd5D6MZJ6 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smpd5D6MZJ6 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smpd5D6MZJ6 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smpd5D6MZJ6 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smpd5D6MZJ6 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smpd5D6MZJ6 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smpd5D6MZJ6 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smpd5D6MZJ6 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smpd5D6MZJ6 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smpd5D6MZJ6 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smpd5D6MZJ6 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smpd5D6MZJ6 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smpd5D6MZJ6 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smpd5D6MZJ6 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smpd5D6MZJ6 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smpd5D6MZJ6 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smpd5D6MZJ6 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smpd5D6MZJ6 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smpd5D6MZJ6 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smpd5D6MZJ6 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smpd5D6MZJ6 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smpd5D6MZJ6 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smpd5D6MZJ6 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smpd5D6MZJ6 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smpd5D6MZJ6 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smpd5D6MZJ6 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smpd5D6MZJ6 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smpd5D6MZJ6 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smpd5D6MZJ6 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smpd5D6MZJ6 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smpd5D6MZJ6 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms