Protein–RNA interactions for Protein: D4PHA7

Wscd2, WSC domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wscd2D4PHA7 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Wscd2D4PHA7 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Wscd2D4PHA7 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Wscd2D4PHA7 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Wscd2D4PHA7 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Wscd2D4PHA7 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Wscd2D4PHA7 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Wscd2D4PHA7 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Wscd2D4PHA7 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Wscd2D4PHA7 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Wscd2D4PHA7 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Wscd2D4PHA7 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Wscd2D4PHA7 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Wscd2D4PHA7 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Wscd2D4PHA7 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Wscd2D4PHA7 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Wscd2D4PHA7 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Wscd2D4PHA7 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Wscd2D4PHA7 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Wscd2D4PHA7 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Wscd2D4PHA7 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Wscd2D4PHA7 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Wscd2D4PHA7 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Wscd2D4PHA7 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Wscd2D4PHA7 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Wscd2D4PHA7 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Wscd2D4PHA7 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Wscd2D4PHA7 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Wscd2D4PHA7 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Wscd2D4PHA7 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Wscd2D4PHA7 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Wscd2D4PHA7 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Wscd2D4PHA7 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Wscd2D4PHA7 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Wscd2D4PHA7 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Wscd2D4PHA7 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Wscd2D4PHA7 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Wscd2D4PHA7 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Wscd2D4PHA7 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Wscd2D4PHA7 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Wscd2D4PHA7 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Wscd2D4PHA7 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Wscd2D4PHA7 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Wscd2D4PHA7 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Wscd2D4PHA7 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Wscd2D4PHA7 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Wscd2D4PHA7 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Wscd2D4PHA7 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Wscd2D4PHA7 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Wscd2D4PHA7 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Wscd2D4PHA7 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Wscd2D4PHA7 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Wscd2D4PHA7 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Wscd2D4PHA7 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Wscd2D4PHA7 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Wscd2D4PHA7 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Wscd2D4PHA7 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Wscd2D4PHA7 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Wscd2D4PHA7 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Wscd2D4PHA7 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Wscd2D4PHA7 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Wscd2D4PHA7 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Wscd2D4PHA7 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Wscd2D4PHA7 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Wscd2D4PHA7 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Wscd2D4PHA7 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Wscd2D4PHA7 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Wscd2D4PHA7 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Wscd2D4PHA7 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Wscd2D4PHA7 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Wscd2D4PHA7 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Wscd2D4PHA7 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Wscd2D4PHA7 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Wscd2D4PHA7 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Wscd2D4PHA7 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Wscd2D4PHA7 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Wscd2D4PHA7 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Wscd2D4PHA7 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Wscd2D4PHA7 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Wscd2D4PHA7 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Wscd2D4PHA7 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Wscd2D4PHA7 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Wscd2D4PHA7 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Wscd2D4PHA7 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Wscd2D4PHA7 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Wscd2D4PHA7 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Wscd2D4PHA7 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Wscd2D4PHA7 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Wscd2D4PHA7 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Wscd2D4PHA7 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Wscd2D4PHA7 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Wscd2D4PHA7 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Wscd2D4PHA7 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Wscd2D4PHA7 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Wscd2D4PHA7 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Wscd2D4PHA7 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Wscd2D4PHA7 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Wscd2D4PHA7 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Wscd2D4PHA7 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Wscd2D4PHA7 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms