Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6L3

Vmn2r49, Vomeronasal 2, receptor 49, mousemouse

Predictions only

Length 852 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r49D3Z6L3 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn2r49D3Z6L3 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn2r49D3Z6L3 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn2r49D3Z6L3 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn2r49D3Z6L3 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn2r49D3Z6L3 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn2r49D3Z6L3 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn2r49D3Z6L3 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn2r49D3Z6L3 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn2r49D3Z6L3 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn2r49D3Z6L3 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn2r49D3Z6L3 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn2r49D3Z6L3 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn2r49D3Z6L3 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn2r49D3Z6L3 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn2r49D3Z6L3 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn2r49D3Z6L3 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn2r49D3Z6L3 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn2r49D3Z6L3 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn2r49D3Z6L3 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn2r49D3Z6L3 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn2r49D3Z6L3 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn2r49D3Z6L3 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn2r49D3Z6L3 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn2r49D3Z6L3 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn2r49D3Z6L3 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn2r49D3Z6L3 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn2r49D3Z6L3 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn2r49D3Z6L3 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn2r49D3Z6L3 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn2r49D3Z6L3 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn2r49D3Z6L3 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn2r49D3Z6L3 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn2r49D3Z6L3 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn2r49D3Z6L3 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn2r49D3Z6L3 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn2r49D3Z6L3 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn2r49D3Z6L3 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn2r49D3Z6L3 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn2r49D3Z6L3 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn2r49D3Z6L3 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn2r49D3Z6L3 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn2r49D3Z6L3 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn2r49D3Z6L3 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn2r49D3Z6L3 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn2r49D3Z6L3 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn2r49D3Z6L3 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn2r49D3Z6L3 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn2r49D3Z6L3 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn2r49D3Z6L3 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn2r49D3Z6L3 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn2r49D3Z6L3 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn2r49D3Z6L3 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn2r49D3Z6L3 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn2r49D3Z6L3 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn2r49D3Z6L3 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn2r49D3Z6L3 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn2r49D3Z6L3 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn2r49D3Z6L3 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn2r49D3Z6L3 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn2r49D3Z6L3 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn2r49D3Z6L3 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn2r49D3Z6L3 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn2r49D3Z6L3 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn2r49D3Z6L3 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn2r49D3Z6L3 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn2r49D3Z6L3 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn2r49D3Z6L3 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn2r49D3Z6L3 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn2r49D3Z6L3 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn2r49D3Z6L3 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn2r49D3Z6L3 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn2r49D3Z6L3 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn2r49D3Z6L3 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn2r49D3Z6L3 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn2r49D3Z6L3 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn2r49D3Z6L3 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn2r49D3Z6L3 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn2r49D3Z6L3 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn2r49D3Z6L3 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn2r49D3Z6L3 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn2r49D3Z6L3 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn2r49D3Z6L3 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn2r49D3Z6L3 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn2r49D3Z6L3 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn2r49D3Z6L3 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn2r49D3Z6L3 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn2r49D3Z6L3 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn2r49D3Z6L3 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn2r49D3Z6L3 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn2r49D3Z6L3 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn2r49D3Z6L3 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn2r49D3Z6L3 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn2r49D3Z6L3 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn2r49D3Z6L3 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn2r49D3Z6L3 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn2r49D3Z6L3 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn2r49D3Z6L3 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn2r49D3Z6L3 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn2r49D3Z6L3 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms