Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5W0

Atp6ap1l, ATPase, H+-transporting, lysosomal accessory protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6ap1lD3Z5W0 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atp6ap1lD3Z5W0 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atp6ap1lD3Z5W0 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atp6ap1lD3Z5W0 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atp6ap1lD3Z5W0 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atp6ap1lD3Z5W0 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atp6ap1lD3Z5W0 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atp6ap1lD3Z5W0 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atp6ap1lD3Z5W0 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atp6ap1lD3Z5W0 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atp6ap1lD3Z5W0 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atp6ap1lD3Z5W0 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atp6ap1lD3Z5W0 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atp6ap1lD3Z5W0 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Atp6ap1lD3Z5W0 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atp6ap1lD3Z5W0 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atp6ap1lD3Z5W0 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atp6ap1lD3Z5W0 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atp6ap1lD3Z5W0 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atp6ap1lD3Z5W0 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atp6ap1lD3Z5W0 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atp6ap1lD3Z5W0 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atp6ap1lD3Z5W0 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Atp6ap1lD3Z5W0 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Atp6ap1lD3Z5W0 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atp6ap1lD3Z5W0 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atp6ap1lD3Z5W0 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atp6ap1lD3Z5W0 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atp6ap1lD3Z5W0 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atp6ap1lD3Z5W0 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atp6ap1lD3Z5W0 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atp6ap1lD3Z5W0 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atp6ap1lD3Z5W0 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atp6ap1lD3Z5W0 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atp6ap1lD3Z5W0 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp6ap1lD3Z5W0 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp6ap1lD3Z5W0 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp6ap1lD3Z5W0 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp6ap1lD3Z5W0 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp6ap1lD3Z5W0 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp6ap1lD3Z5W0 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp6ap1lD3Z5W0 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp6ap1lD3Z5W0 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp6ap1lD3Z5W0 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp6ap1lD3Z5W0 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp6ap1lD3Z5W0 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp6ap1lD3Z5W0 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp6ap1lD3Z5W0 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp6ap1lD3Z5W0 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp6ap1lD3Z5W0 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp6ap1lD3Z5W0 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp6ap1lD3Z5W0 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp6ap1lD3Z5W0 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp6ap1lD3Z5W0 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp6ap1lD3Z5W0 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp6ap1lD3Z5W0 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp6ap1lD3Z5W0 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp6ap1lD3Z5W0 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp6ap1lD3Z5W0 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp6ap1lD3Z5W0 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp6ap1lD3Z5W0 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp6ap1lD3Z5W0 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp6ap1lD3Z5W0 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp6ap1lD3Z5W0 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp6ap1lD3Z5W0 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp6ap1lD3Z5W0 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp6ap1lD3Z5W0 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp6ap1lD3Z5W0 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp6ap1lD3Z5W0 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp6ap1lD3Z5W0 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp6ap1lD3Z5W0 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp6ap1lD3Z5W0 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp6ap1lD3Z5W0 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atp6ap1lD3Z5W0 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atp6ap1lD3Z5W0 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atp6ap1lD3Z5W0 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atp6ap1lD3Z5W0 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atp6ap1lD3Z5W0 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atp6ap1lD3Z5W0 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atp6ap1lD3Z5W0 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp6ap1lD3Z5W0 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp6ap1lD3Z5W0 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp6ap1lD3Z5W0 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp6ap1lD3Z5W0 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms