Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tpm3-rs7D3Z2H9 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tpm3-rs7D3Z2H9 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tpm3-rs7D3Z2H9 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms