Protein–RNA interactions for Protein: D3Z1D3

3425401B19Rik, RIKEN cDNA 3425401B19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 1,412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
3425401B19RikD3Z1D3 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
3425401B19RikD3Z1D3 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
3425401B19RikD3Z1D3 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
3425401B19RikD3Z1D3 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
3425401B19RikD3Z1D3 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
3425401B19RikD3Z1D3 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
3425401B19RikD3Z1D3 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
3425401B19RikD3Z1D3 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
3425401B19RikD3Z1D3 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
3425401B19RikD3Z1D3 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
3425401B19RikD3Z1D3 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
3425401B19RikD3Z1D3 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
3425401B19RikD3Z1D3 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
3425401B19RikD3Z1D3 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
3425401B19RikD3Z1D3 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
3425401B19RikD3Z1D3 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
3425401B19RikD3Z1D3 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
3425401B19RikD3Z1D3 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
3425401B19RikD3Z1D3 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
3425401B19RikD3Z1D3 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
3425401B19RikD3Z1D3 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
3425401B19RikD3Z1D3 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
3425401B19RikD3Z1D3 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
3425401B19RikD3Z1D3 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
3425401B19RikD3Z1D3 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
3425401B19RikD3Z1D3 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
3425401B19RikD3Z1D3 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
3425401B19RikD3Z1D3 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
3425401B19RikD3Z1D3 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
3425401B19RikD3Z1D3 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
3425401B19RikD3Z1D3 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
3425401B19RikD3Z1D3 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
3425401B19RikD3Z1D3 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
3425401B19RikD3Z1D3 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
3425401B19RikD3Z1D3 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
3425401B19RikD3Z1D3 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
3425401B19RikD3Z1D3 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC25■■□□□ 1.59
3425401B19RikD3Z1D3 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
3425401B19RikD3Z1D3 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
3425401B19RikD3Z1D3 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
3425401B19RikD3Z1D3 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
3425401B19RikD3Z1D3 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
3425401B19RikD3Z1D3 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
3425401B19RikD3Z1D3 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
3425401B19RikD3Z1D3 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
3425401B19RikD3Z1D3 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
3425401B19RikD3Z1D3 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
3425401B19RikD3Z1D3 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
3425401B19RikD3Z1D3 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
3425401B19RikD3Z1D3 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
3425401B19RikD3Z1D3 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
3425401B19RikD3Z1D3 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
3425401B19RikD3Z1D3 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
3425401B19RikD3Z1D3 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
3425401B19RikD3Z1D3 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
3425401B19RikD3Z1D3 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
3425401B19RikD3Z1D3 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
3425401B19RikD3Z1D3 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
3425401B19RikD3Z1D3 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
3425401B19RikD3Z1D3 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
3425401B19RikD3Z1D3 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
3425401B19RikD3Z1D3 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
3425401B19RikD3Z1D3 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
3425401B19RikD3Z1D3 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
3425401B19RikD3Z1D3 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
3425401B19RikD3Z1D3 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
3425401B19RikD3Z1D3 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
3425401B19RikD3Z1D3 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
3425401B19RikD3Z1D3 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
3425401B19RikD3Z1D3 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
3425401B19RikD3Z1D3 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
3425401B19RikD3Z1D3 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
3425401B19RikD3Z1D3 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
3425401B19RikD3Z1D3 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
3425401B19RikD3Z1D3 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
3425401B19RikD3Z1D3 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
3425401B19RikD3Z1D3 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
3425401B19RikD3Z1D3 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
3425401B19RikD3Z1D3 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
3425401B19RikD3Z1D3 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
3425401B19RikD3Z1D3 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
3425401B19RikD3Z1D3 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
3425401B19RikD3Z1D3 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
3425401B19RikD3Z1D3 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
3425401B19RikD3Z1D3 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
3425401B19RikD3Z1D3 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
3425401B19RikD3Z1D3 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
3425401B19RikD3Z1D3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
3425401B19RikD3Z1D3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
3425401B19RikD3Z1D3 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
3425401B19RikD3Z1D3 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
3425401B19RikD3Z1D3 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
3425401B19RikD3Z1D3 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
3425401B19RikD3Z1D3 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
3425401B19RikD3Z1D3 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
3425401B19RikD3Z1D3 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
3425401B19RikD3Z1D3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
3425401B19RikD3Z1D3 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
3425401B19RikD3Z1D3 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
3425401B19RikD3Z1D3 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms