Protein–RNA interactions for Protein: D3YUM8

Gm4950, Proteasome subunit beta type, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4950D3YUM8 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
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Gm4950D3YUM8 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm4950D3YUM8 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm4950D3YUM8 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm4950D3YUM8 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm4950D3YUM8 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm4950D3YUM8 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm4950D3YUM8 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm4950D3YUM8 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm4950D3YUM8 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm4950D3YUM8 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm4950D3YUM8 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm4950D3YUM8 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm4950D3YUM8 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Gm4950D3YUM8 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm4950D3YUM8 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm4950D3YUM8 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm4950D3YUM8 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm4950D3YUM8 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm4950D3YUM8 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm4950D3YUM8 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm4950D3YUM8 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm4950D3YUM8 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm4950D3YUM8 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Gm4950D3YUM8 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Gm4950D3YUM8 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Gm4950D3YUM8 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Gm4950D3YUM8 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Gm4950D3YUM8 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm4950D3YUM8 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm4950D3YUM8 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm4950D3YUM8 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm4950D3YUM8 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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Gm4950D3YUM8 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm4950D3YUM8 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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Gm4950D3YUM8 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm4950D3YUM8 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm4950D3YUM8 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Gm4950D3YUM8 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm4950D3YUM8 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm4950D3YUM8 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Gm4950D3YUM8 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm4950D3YUM8 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm4950D3YUM8 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm4950D3YUM8 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm4950D3YUM8 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm4950D3YUM8 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm4950D3YUM8 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm4950D3YUM8 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm4950D3YUM8 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm4950D3YUM8 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm4950D3YUM8 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm4950D3YUM8 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm4950D3YUM8 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm4950D3YUM8 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm4950D3YUM8 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm4950D3YUM8 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm4950D3YUM8 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm4950D3YUM8 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm4950D3YUM8 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm4950D3YUM8 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm4950D3YUM8 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm4950D3YUM8 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm4950D3YUM8 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm4950D3YUM8 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm4950D3YUM8 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm4950D3YUM8 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm4950D3YUM8 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm4950D3YUM8 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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