Protein–RNA interactions for Protein: B9EJA2

Cttnbp2, Cortactin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2B9EJA2 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Cttnbp2B9EJA2 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Cttnbp2B9EJA2 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Cttnbp2B9EJA2 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Cttnbp2B9EJA2 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Cttnbp2B9EJA2 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Cttnbp2B9EJA2 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Cttnbp2B9EJA2 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Cttnbp2B9EJA2 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Cttnbp2B9EJA2 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Cttnbp2B9EJA2 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Cttnbp2B9EJA2 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Cttnbp2B9EJA2 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Cttnbp2B9EJA2 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Cttnbp2B9EJA2 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Cttnbp2B9EJA2 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Cttnbp2B9EJA2 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Cttnbp2B9EJA2 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Cttnbp2B9EJA2 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Cttnbp2B9EJA2 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Cttnbp2B9EJA2 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Cttnbp2B9EJA2 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Cttnbp2B9EJA2 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Cttnbp2B9EJA2 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
Cttnbp2B9EJA2 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Cttnbp2B9EJA2 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC28.76■■■□□ 2.2
Cttnbp2B9EJA2 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
Cttnbp2B9EJA2 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Cttnbp2B9EJA2 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
Cttnbp2B9EJA2 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC28.76■■■□□ 2.2
Cttnbp2B9EJA2 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Cttnbp2B9EJA2 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Cttnbp2B9EJA2 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Cttnbp2B9EJA2 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Cttnbp2B9EJA2 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Cttnbp2B9EJA2 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Cttnbp2B9EJA2 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Cttnbp2B9EJA2 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Cttnbp2B9EJA2 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Cttnbp2B9EJA2 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Cttnbp2B9EJA2 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Cttnbp2B9EJA2 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Cttnbp2B9EJA2 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Cttnbp2B9EJA2 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Cttnbp2B9EJA2 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Cttnbp2B9EJA2 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Cttnbp2B9EJA2 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Cttnbp2B9EJA2 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Cttnbp2B9EJA2 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Cttnbp2B9EJA2 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Cttnbp2B9EJA2 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Cttnbp2B9EJA2 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Cttnbp2B9EJA2 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Cttnbp2B9EJA2 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Cttnbp2B9EJA2 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Cttnbp2B9EJA2 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Cttnbp2B9EJA2 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Cttnbp2B9EJA2 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Cttnbp2B9EJA2 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Cttnbp2B9EJA2 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Cttnbp2B9EJA2 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Cttnbp2B9EJA2 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Cttnbp2B9EJA2 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Cttnbp2B9EJA2 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Cttnbp2B9EJA2 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Cttnbp2B9EJA2 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Cttnbp2B9EJA2 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Cttnbp2B9EJA2 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Cttnbp2B9EJA2 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Cttnbp2B9EJA2 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Cttnbp2B9EJA2 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Cttnbp2B9EJA2 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Cttnbp2B9EJA2 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Cttnbp2B9EJA2 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Cttnbp2B9EJA2 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Cttnbp2B9EJA2 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Cttnbp2B9EJA2 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Cttnbp2B9EJA2 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Cttnbp2B9EJA2 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Cttnbp2B9EJA2 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Cttnbp2B9EJA2 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Cttnbp2B9EJA2 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Cttnbp2B9EJA2 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Cttnbp2B9EJA2 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Cttnbp2B9EJA2 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Cttnbp2B9EJA2 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Cttnbp2B9EJA2 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Cttnbp2B9EJA2 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Cttnbp2B9EJA2 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Cttnbp2B9EJA2 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Cttnbp2B9EJA2 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Cttnbp2B9EJA2 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Cttnbp2B9EJA2 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Cttnbp2B9EJA2 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Cttnbp2B9EJA2 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Cttnbp2B9EJA2 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Cttnbp2B9EJA2 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Cttnbp2B9EJA2 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Cttnbp2B9EJA2 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Cttnbp2B9EJA2 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms