Protein–RNA interactions for Protein: B2RX88

Cspp1, Centrosome and spindle pole associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspp1B2RX88 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cspp1B2RX88 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cspp1B2RX88 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cspp1B2RX88 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cspp1B2RX88 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cspp1B2RX88 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cspp1B2RX88 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cspp1B2RX88 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cspp1B2RX88 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Cspp1B2RX88 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cspp1B2RX88 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cspp1B2RX88 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cspp1B2RX88 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cspp1B2RX88 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cspp1B2RX88 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cspp1B2RX88 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cspp1B2RX88 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cspp1B2RX88 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cspp1B2RX88 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cspp1B2RX88 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cspp1B2RX88 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cspp1B2RX88 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cspp1B2RX88 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cspp1B2RX88 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cspp1B2RX88 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cspp1B2RX88 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cspp1B2RX88 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cspp1B2RX88 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Cspp1B2RX88 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cspp1B2RX88 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cspp1B2RX88 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cspp1B2RX88 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cspp1B2RX88 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cspp1B2RX88 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cspp1B2RX88 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cspp1B2RX88 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cspp1B2RX88 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cspp1B2RX88 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cspp1B2RX88 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cspp1B2RX88 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cspp1B2RX88 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Cspp1B2RX88 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cspp1B2RX88 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cspp1B2RX88 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cspp1B2RX88 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cspp1B2RX88 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cspp1B2RX88 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cspp1B2RX88 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cspp1B2RX88 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cspp1B2RX88 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cspp1B2RX88 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cspp1B2RX88 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cspp1B2RX88 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cspp1B2RX88 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cspp1B2RX88 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cspp1B2RX88 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cspp1B2RX88 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cspp1B2RX88 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cspp1B2RX88 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Cspp1B2RX88 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Cspp1B2RX88 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cspp1B2RX88 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Cspp1B2RX88 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cspp1B2RX88 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Cspp1B2RX88 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cspp1B2RX88 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cspp1B2RX88 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cspp1B2RX88 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cspp1B2RX88 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cspp1B2RX88 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cspp1B2RX88 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cspp1B2RX88 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cspp1B2RX88 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cspp1B2RX88 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cspp1B2RX88 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cspp1B2RX88 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cspp1B2RX88 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Cspp1B2RX88 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cspp1B2RX88 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cspp1B2RX88 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cspp1B2RX88 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cspp1B2RX88 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cspp1B2RX88 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Cspp1B2RX88 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cspp1B2RX88 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cspp1B2RX88 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cspp1B2RX88 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cspp1B2RX88 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cspp1B2RX88 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Cspp1B2RX88 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cspp1B2RX88 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cspp1B2RX88 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cspp1B2RX88 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cspp1B2RX88 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cspp1B2RX88 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cspp1B2RX88 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cspp1B2RX88 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cspp1B2RX88 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cspp1B2RX88 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cspp1B2RX88 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms