Protein–RNA interactions for Protein: B2RX70

Cped1, Cadherin-like and PC-esterase domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cped1B2RX70 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cped1B2RX70 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cped1B2RX70 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cped1B2RX70 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cped1B2RX70 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cped1B2RX70 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cped1B2RX70 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cped1B2RX70 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cped1B2RX70 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cped1B2RX70 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cped1B2RX70 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cped1B2RX70 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cped1B2RX70 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cped1B2RX70 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cped1B2RX70 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cped1B2RX70 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cped1B2RX70 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cped1B2RX70 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cped1B2RX70 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cped1B2RX70 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cped1B2RX70 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cped1B2RX70 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cped1B2RX70 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cped1B2RX70 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cped1B2RX70 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cped1B2RX70 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cped1B2RX70 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cped1B2RX70 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cped1B2RX70 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cped1B2RX70 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cped1B2RX70 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cped1B2RX70 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cped1B2RX70 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cped1B2RX70 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cped1B2RX70 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cped1B2RX70 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cped1B2RX70 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cped1B2RX70 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cped1B2RX70 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cped1B2RX70 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cped1B2RX70 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cped1B2RX70 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cped1B2RX70 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cped1B2RX70 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cped1B2RX70 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cped1B2RX70 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cped1B2RX70 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cped1B2RX70 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cped1B2RX70 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cped1B2RX70 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cped1B2RX70 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cped1B2RX70 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cped1B2RX70 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cped1B2RX70 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cped1B2RX70 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cped1B2RX70 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cped1B2RX70 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cped1B2RX70 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cped1B2RX70 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cped1B2RX70 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cped1B2RX70 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cped1B2RX70 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cped1B2RX70 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cped1B2RX70 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cped1B2RX70 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cped1B2RX70 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cped1B2RX70 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cped1B2RX70 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cped1B2RX70 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cped1B2RX70 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cped1B2RX70 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cped1B2RX70 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cped1B2RX70 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cped1B2RX70 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cped1B2RX70 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cped1B2RX70 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cped1B2RX70 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cped1B2RX70 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cped1B2RX70 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cped1B2RX70 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cped1B2RX70 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cped1B2RX70 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cped1B2RX70 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cped1B2RX70 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cped1B2RX70 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cped1B2RX70 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cped1B2RX70 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cped1B2RX70 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cped1B2RX70 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cped1B2RX70 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cped1B2RX70 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cped1B2RX70 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cped1B2RX70 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cped1B2RX70 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cped1B2RX70 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cped1B2RX70 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cped1B2RX70 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cped1B2RX70 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cped1B2RX70 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cped1B2RX70 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms