Protein–RNA interactions for Protein: B2RW27

1700018F24Rik, 1700018F24Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700018F24RikB2RW27 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
1700018F24RikB2RW27 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
1700018F24RikB2RW27 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
1700018F24RikB2RW27 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
1700018F24RikB2RW27 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
1700018F24RikB2RW27 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
1700018F24RikB2RW27 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
1700018F24RikB2RW27 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
1700018F24RikB2RW27 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
1700018F24RikB2RW27 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
1700018F24RikB2RW27 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
1700018F24RikB2RW27 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
1700018F24RikB2RW27 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
1700018F24RikB2RW27 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
1700018F24RikB2RW27 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
1700018F24RikB2RW27 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
1700018F24RikB2RW27 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
1700018F24RikB2RW27 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
1700018F24RikB2RW27 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
1700018F24RikB2RW27 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
1700018F24RikB2RW27 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
1700018F24RikB2RW27 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
1700018F24RikB2RW27 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
1700018F24RikB2RW27 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
1700018F24RikB2RW27 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
1700018F24RikB2RW27 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
1700018F24RikB2RW27 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
1700018F24RikB2RW27 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
1700018F24RikB2RW27 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
1700018F24RikB2RW27 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
1700018F24RikB2RW27 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
1700018F24RikB2RW27 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
1700018F24RikB2RW27 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
1700018F24RikB2RW27 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
1700018F24RikB2RW27 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
1700018F24RikB2RW27 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
1700018F24RikB2RW27 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
1700018F24RikB2RW27 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
1700018F24RikB2RW27 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
1700018F24RikB2RW27 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
1700018F24RikB2RW27 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
1700018F24RikB2RW27 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
1700018F24RikB2RW27 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
1700018F24RikB2RW27 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
1700018F24RikB2RW27 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
1700018F24RikB2RW27 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
1700018F24RikB2RW27 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
1700018F24RikB2RW27 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
1700018F24RikB2RW27 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
1700018F24RikB2RW27 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
1700018F24RikB2RW27 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
1700018F24RikB2RW27 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
1700018F24RikB2RW27 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
1700018F24RikB2RW27 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
1700018F24RikB2RW27 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
1700018F24RikB2RW27 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
1700018F24RikB2RW27 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
1700018F24RikB2RW27 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
1700018F24RikB2RW27 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
1700018F24RikB2RW27 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
1700018F24RikB2RW27 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
1700018F24RikB2RW27 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
1700018F24RikB2RW27 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
1700018F24RikB2RW27 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
1700018F24RikB2RW27 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
1700018F24RikB2RW27 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
1700018F24RikB2RW27 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
1700018F24RikB2RW27 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
1700018F24RikB2RW27 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
1700018F24RikB2RW27 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
1700018F24RikB2RW27 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
1700018F24RikB2RW27 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
1700018F24RikB2RW27 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
1700018F24RikB2RW27 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
1700018F24RikB2RW27 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
1700018F24RikB2RW27 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
1700018F24RikB2RW27 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
1700018F24RikB2RW27 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
1700018F24RikB2RW27 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
1700018F24RikB2RW27 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
1700018F24RikB2RW27 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
1700018F24RikB2RW27 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
1700018F24RikB2RW27 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
1700018F24RikB2RW27 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
1700018F24RikB2RW27 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
1700018F24RikB2RW27 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
1700018F24RikB2RW27 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
1700018F24RikB2RW27 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
1700018F24RikB2RW27 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
1700018F24RikB2RW27 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
1700018F24RikB2RW27 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
1700018F24RikB2RW27 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
1700018F24RikB2RW27 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
1700018F24RikB2RW27 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
1700018F24RikB2RW27 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
1700018F24RikB2RW27 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
1700018F24RikB2RW27 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
1700018F24RikB2RW27 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
1700018F24RikB2RW27 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
1700018F24RikB2RW27 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms