Protein–RNA interactions for Protein: B2RRE7

Otud4, OTU domain-containing protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud4B2RRE7 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Otud4B2RRE7 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Otud4B2RRE7 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Otud4B2RRE7 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Otud4B2RRE7 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Otud4B2RRE7 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Otud4B2RRE7 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Otud4B2RRE7 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Otud4B2RRE7 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Otud4B2RRE7 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Otud4B2RRE7 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Otud4B2RRE7 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Otud4B2RRE7 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Otud4B2RRE7 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Otud4B2RRE7 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Otud4B2RRE7 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Otud4B2RRE7 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Otud4B2RRE7 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Otud4B2RRE7 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Otud4B2RRE7 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Otud4B2RRE7 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Otud4B2RRE7 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Otud4B2RRE7 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Otud4B2RRE7 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Otud4B2RRE7 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Otud4B2RRE7 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Otud4B2RRE7 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Otud4B2RRE7 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Otud4B2RRE7 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Otud4B2RRE7 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Otud4B2RRE7 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Otud4B2RRE7 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Otud4B2RRE7 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Otud4B2RRE7 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Otud4B2RRE7 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Otud4B2RRE7 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Otud4B2RRE7 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Otud4B2RRE7 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Otud4B2RRE7 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Otud4B2RRE7 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Otud4B2RRE7 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Otud4B2RRE7 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Otud4B2RRE7 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Otud4B2RRE7 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Otud4B2RRE7 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Otud4B2RRE7 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Otud4B2RRE7 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Otud4B2RRE7 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Otud4B2RRE7 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Otud4B2RRE7 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Otud4B2RRE7 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Otud4B2RRE7 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Otud4B2RRE7 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Otud4B2RRE7 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Otud4B2RRE7 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Otud4B2RRE7 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Otud4B2RRE7 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Otud4B2RRE7 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Otud4B2RRE7 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Otud4B2RRE7 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Otud4B2RRE7 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Otud4B2RRE7 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Otud4B2RRE7 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Otud4B2RRE7 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Otud4B2RRE7 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Otud4B2RRE7 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Otud4B2RRE7 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Otud4B2RRE7 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Otud4B2RRE7 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Otud4B2RRE7 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Otud4B2RRE7 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Otud4B2RRE7 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Otud4B2RRE7 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Otud4B2RRE7 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Otud4B2RRE7 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Otud4B2RRE7 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Otud4B2RRE7 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Otud4B2RRE7 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otud4B2RRE7 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otud4B2RRE7 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otud4B2RRE7 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otud4B2RRE7 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otud4B2RRE7 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otud4B2RRE7 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Otud4B2RRE7 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otud4B2RRE7 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Otud4B2RRE7 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otud4B2RRE7 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otud4B2RRE7 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otud4B2RRE7 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otud4B2RRE7 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otud4B2RRE7 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otud4B2RRE7 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otud4B2RRE7 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otud4B2RRE7 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otud4B2RRE7 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otud4B2RRE7 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otud4B2RRE7 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otud4B2RRE7 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otud4B2RRE7 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms