Protein–RNA interactions for Protein: B2RQG2

Phf3, PHD finger protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf3B2RQG2 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phf3B2RQG2 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phf3B2RQG2 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phf3B2RQG2 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phf3B2RQG2 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phf3B2RQG2 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phf3B2RQG2 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phf3B2RQG2 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phf3B2RQG2 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phf3B2RQG2 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phf3B2RQG2 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phf3B2RQG2 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phf3B2RQG2 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phf3B2RQG2 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phf3B2RQG2 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phf3B2RQG2 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phf3B2RQG2 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Phf3B2RQG2 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Phf3B2RQG2 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Phf3B2RQG2 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Phf3B2RQG2 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Phf3B2RQG2 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Phf3B2RQG2 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Phf3B2RQG2 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Phf3B2RQG2 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Phf3B2RQG2 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Phf3B2RQG2 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Phf3B2RQG2 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Phf3B2RQG2 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Phf3B2RQG2 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Phf3B2RQG2 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Phf3B2RQG2 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Phf3B2RQG2 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Phf3B2RQG2 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Phf3B2RQG2 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Phf3B2RQG2 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Phf3B2RQG2 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Phf3B2RQG2 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Phf3B2RQG2 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Phf3B2RQG2 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Phf3B2RQG2 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Phf3B2RQG2 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Phf3B2RQG2 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Phf3B2RQG2 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Phf3B2RQG2 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Phf3B2RQG2 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Phf3B2RQG2 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Phf3B2RQG2 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Phf3B2RQG2 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Phf3B2RQG2 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Phf3B2RQG2 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Phf3B2RQG2 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Phf3B2RQG2 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Phf3B2RQG2 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Phf3B2RQG2 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Phf3B2RQG2 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Phf3B2RQG2 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Phf3B2RQG2 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Phf3B2RQG2 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Phf3B2RQG2 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Phf3B2RQG2 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Phf3B2RQG2 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Phf3B2RQG2 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Phf3B2RQG2 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Phf3B2RQG2 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Phf3B2RQG2 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Phf3B2RQG2 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Phf3B2RQG2 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Phf3B2RQG2 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Phf3B2RQG2 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Phf3B2RQG2 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Phf3B2RQG2 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Phf3B2RQG2 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Phf3B2RQG2 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Phf3B2RQG2 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Phf3B2RQG2 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Phf3B2RQG2 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Phf3B2RQG2 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Phf3B2RQG2 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Phf3B2RQG2 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Phf3B2RQG2 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Phf3B2RQG2 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Phf3B2RQG2 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Phf3B2RQG2 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Phf3B2RQG2 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Phf3B2RQG2 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Phf3B2RQG2 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Phf3B2RQG2 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Phf3B2RQG2 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Phf3B2RQG2 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Phf3B2RQG2 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Phf3B2RQG2 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Phf3B2RQG2 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Phf3B2RQG2 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Phf3B2RQG2 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Phf3B2RQG2 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Phf3B2RQG2 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Phf3B2RQG2 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Phf3B2RQG2 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Phf3B2RQG2 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms