Protein–RNA interactions for Protein: B2RPU8

Zbed5, MCG130675, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed5B2RPU8 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Zbed5B2RPU8 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Zbed5B2RPU8 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Zbed5B2RPU8 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Zbed5B2RPU8 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Zbed5B2RPU8 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Zbed5B2RPU8 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Zbed5B2RPU8 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Zbed5B2RPU8 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Zbed5B2RPU8 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Zbed5B2RPU8 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Zbed5B2RPU8 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Zbed5B2RPU8 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Zbed5B2RPU8 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Zbed5B2RPU8 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Zbed5B2RPU8 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Zbed5B2RPU8 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Zbed5B2RPU8 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Zbed5B2RPU8 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Zbed5B2RPU8 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Zbed5B2RPU8 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Zbed5B2RPU8 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Zbed5B2RPU8 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Zbed5B2RPU8 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Zbed5B2RPU8 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Zbed5B2RPU8 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Zbed5B2RPU8 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Zbed5B2RPU8 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Zbed5B2RPU8 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Zbed5B2RPU8 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Zbed5B2RPU8 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Zbed5B2RPU8 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Zbed5B2RPU8 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Zbed5B2RPU8 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Zbed5B2RPU8 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Zbed5B2RPU8 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Zbed5B2RPU8 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Zbed5B2RPU8 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Zbed5B2RPU8 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Zbed5B2RPU8 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Zbed5B2RPU8 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Zbed5B2RPU8 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Zbed5B2RPU8 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Zbed5B2RPU8 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Zbed5B2RPU8 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Zbed5B2RPU8 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Zbed5B2RPU8 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Zbed5B2RPU8 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Zbed5B2RPU8 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Zbed5B2RPU8 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Zbed5B2RPU8 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Zbed5B2RPU8 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Zbed5B2RPU8 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Zbed5B2RPU8 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Zbed5B2RPU8 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Zbed5B2RPU8 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Zbed5B2RPU8 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Zbed5B2RPU8 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Zbed5B2RPU8 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Zbed5B2RPU8 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Zbed5B2RPU8 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Zbed5B2RPU8 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Zbed5B2RPU8 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Zbed5B2RPU8 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Zbed5B2RPU8 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Zbed5B2RPU8 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Zbed5B2RPU8 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Zbed5B2RPU8 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Zbed5B2RPU8 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Zbed5B2RPU8 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Zbed5B2RPU8 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Zbed5B2RPU8 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Zbed5B2RPU8 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Zbed5B2RPU8 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Zbed5B2RPU8 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Zbed5B2RPU8 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Zbed5B2RPU8 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Zbed5B2RPU8 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Zbed5B2RPU8 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Zbed5B2RPU8 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Zbed5B2RPU8 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Zbed5B2RPU8 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Zbed5B2RPU8 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Zbed5B2RPU8 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Zbed5B2RPU8 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Zbed5B2RPU8 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Zbed5B2RPU8 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Zbed5B2RPU8 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Zbed5B2RPU8 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Zbed5B2RPU8 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Zbed5B2RPU8 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Zbed5B2RPU8 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Zbed5B2RPU8 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Zbed5B2RPU8 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Zbed5B2RPU8 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Zbed5B2RPU8 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Zbed5B2RPU8 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Zbed5B2RPU8 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Zbed5B2RPU8 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Zbed5B2RPU8 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 173.7 ms