Protein–RNA interactions for Protein: B1AWZ3

Nipsnap3a, Nipsnap homolog 3A, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3aB1AWZ3 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nipsnap3aB1AWZ3 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nipsnap3aB1AWZ3 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Nipsnap3aB1AWZ3 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nipsnap3aB1AWZ3 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nipsnap3aB1AWZ3 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Nipsnap3aB1AWZ3 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nipsnap3aB1AWZ3 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nipsnap3aB1AWZ3 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nipsnap3aB1AWZ3 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nipsnap3aB1AWZ3 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nipsnap3aB1AWZ3 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nipsnap3aB1AWZ3 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nipsnap3aB1AWZ3 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nipsnap3aB1AWZ3 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nipsnap3aB1AWZ3 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nipsnap3aB1AWZ3 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nipsnap3aB1AWZ3 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nipsnap3aB1AWZ3 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nipsnap3aB1AWZ3 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nipsnap3aB1AWZ3 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nipsnap3aB1AWZ3 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Nipsnap3aB1AWZ3 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nipsnap3aB1AWZ3 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nipsnap3aB1AWZ3 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nipsnap3aB1AWZ3 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nipsnap3aB1AWZ3 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nipsnap3aB1AWZ3 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nipsnap3aB1AWZ3 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nipsnap3aB1AWZ3 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nipsnap3aB1AWZ3 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nipsnap3aB1AWZ3 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nipsnap3aB1AWZ3 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nipsnap3aB1AWZ3 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nipsnap3aB1AWZ3 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Nipsnap3aB1AWZ3 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nipsnap3aB1AWZ3 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nipsnap3aB1AWZ3 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nipsnap3aB1AWZ3 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nipsnap3aB1AWZ3 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Nipsnap3aB1AWZ3 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nipsnap3aB1AWZ3 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nipsnap3aB1AWZ3 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nipsnap3aB1AWZ3 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nipsnap3aB1AWZ3 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nipsnap3aB1AWZ3 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nipsnap3aB1AWZ3 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nipsnap3aB1AWZ3 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nipsnap3aB1AWZ3 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nipsnap3aB1AWZ3 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nipsnap3aB1AWZ3 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nipsnap3aB1AWZ3 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nipsnap3aB1AWZ3 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nipsnap3aB1AWZ3 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nipsnap3aB1AWZ3 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nipsnap3aB1AWZ3 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nipsnap3aB1AWZ3 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nipsnap3aB1AWZ3 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nipsnap3aB1AWZ3 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nipsnap3aB1AWZ3 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Nipsnap3aB1AWZ3 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Nipsnap3aB1AWZ3 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms