Protein–RNA interactions for Protein: B1AV60

Nhs, NHS actin-remodeling regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NhsB1AV60 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NhsB1AV60 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
NhsB1AV60 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NhsB1AV60 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NhsB1AV60 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
NhsB1AV60 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NhsB1AV60 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NhsB1AV60 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
NhsB1AV60 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
NhsB1AV60 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
NhsB1AV60 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NhsB1AV60 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NhsB1AV60 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NhsB1AV60 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NhsB1AV60 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
NhsB1AV60 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NhsB1AV60 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NhsB1AV60 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NhsB1AV60 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NhsB1AV60 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NhsB1AV60 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NhsB1AV60 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NhsB1AV60 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NhsB1AV60 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NhsB1AV60 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NhsB1AV60 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NhsB1AV60 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NhsB1AV60 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NhsB1AV60 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NhsB1AV60 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NhsB1AV60 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NhsB1AV60 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NhsB1AV60 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NhsB1AV60 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NhsB1AV60 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
NhsB1AV60 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NhsB1AV60 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NhsB1AV60 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NhsB1AV60 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
NhsB1AV60 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NhsB1AV60 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NhsB1AV60 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NhsB1AV60 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NhsB1AV60 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NhsB1AV60 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NhsB1AV60 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NhsB1AV60 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NhsB1AV60 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NhsB1AV60 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
NhsB1AV60 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NhsB1AV60 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NhsB1AV60 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
NhsB1AV60 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NhsB1AV60 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
NhsB1AV60 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NhsB1AV60 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NhsB1AV60 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NhsB1AV60 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NhsB1AV60 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NhsB1AV60 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NhsB1AV60 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NhsB1AV60 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NhsB1AV60 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NhsB1AV60 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NhsB1AV60 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NhsB1AV60 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NhsB1AV60 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NhsB1AV60 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NhsB1AV60 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NhsB1AV60 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NhsB1AV60 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
NhsB1AV60 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
NhsB1AV60 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NhsB1AV60 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NhsB1AV60 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NhsB1AV60 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NhsB1AV60 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NhsB1AV60 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NhsB1AV60 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NhsB1AV60 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NhsB1AV60 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NhsB1AV60 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.64
NhsB1AV60 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NhsB1AV60 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NhsB1AV60 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NhsB1AV60 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NhsB1AV60 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NhsB1AV60 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NhsB1AV60 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NhsB1AV60 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NhsB1AV60 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NhsB1AV60 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NhsB1AV60 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
NhsB1AV60 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
NhsB1AV60 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
NhsB1AV60 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NhsB1AV60 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NhsB1AV60 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NhsB1AV60 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NhsB1AV60 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms